RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W YDR278CQ05612 105 aa13.47□□□□□ -0.25
SSA4YER103W CIR2Q08822 631 aa13.47□□□□□ -0.25
SSA4YER103W RRT2P38332 387 aa13.46□□□□□ -0.25
SSA4YER103W SET2P46995 733 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SSA4YER103W BNI5P53890 448 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SSA4YER103W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SSA4YER103W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SSA4YER103W TRM11Q12463 433 aa13.46□□□□□ -0.25
SSA4YER103W RPC19P28000 142 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W BUD2P33314 1104 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W STN1P38960 494 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W FMS1P50264 508 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W SFB2P53953 876 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W RPM2Q02773 1202 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W CSM3Q04659 317 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W DON1Q05610 365 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W ENO1P00924 437 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W KIP2P28743 706 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W RAM2P29703 316 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W VHC1P38329 1120 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W END3P39013 349 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W PPM1Q04081 328 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W NYV1Q12255 253 aa13.45□□□□□ -0.26
SSA4YER103W TRK2P28584 889 aa13.44□□□□□ -0.26
SSA4YER103W AST1P35183 429 aa13.44□□□□□ -0.26
SSA4YER103W PSY2P40164 858 aa13.44□□□□□ -0.26
SSA4YER103W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SSA4YER103W YRB1P41920 201 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SSA4YER103W FMP33P46998 180 aa13.44□□□□□ -0.26
SSA4YER103W UBX4P54730 416 aa13.44□□□□□ -0.26
SSA4YER103W ATG17Q06410 417 aa13.44□□□□□ -0.26
SSA4YER103W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SSA4YER103W COBP00163 385 aa13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W SBP1P10080 294 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W CBF1P17106 351 aa13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W TRM2P33753 639 aa13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W SRL3P36167 246 aa13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W EXO84P38261 753 aa13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W MSG5P38590 489 aa13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W GUP1P53154 560 aa13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data13.43□□□□□ -0.26not detected
SSA4YER103W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W EFT1P32324 842 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W MDL2P33311 773 aa13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W KES1P35844 434 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W RBL2P48606 106 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W COG6P53959 839 aa13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W YLR297WQ05899 129 aa13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W YPL260WQ08977 551 aa13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W DPH6Q12429 685 aa13.43□□□□□ -0.26
SSA4YER103W FIG2P25653 1609 aa13.42□□□□□ -0.26
SSA4YER103W YAK1P14680 807 aa13.42□□□□□ -0.26
SSA4YER103W HEM15P16622 393 aa13.42□□□□□ -0.26
SSA4YER103W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data13.42□□□□□ -0.26not detected
SSA4YER103W ACL4Q03771 387 aa13.42□□□□□ -0.26
SSA4YER103W YLH47Q06493 454 aa13.42□□□□□ -0.26
SSA4YER103W NSE1Q07913 336 aa13.42□□□□□ -0.26
SSA4YER103W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SSA4YER103W BUG1Q12191 341 aa13.42□□□□□ -0.26
SSA4YER103W MRPL25P23369 157 aa13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W FRD1P32614 470 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W RIB7P33312 244 aa13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W MSN5P52918 1224 aa13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W TEL2P53038 688 aa13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W OSH6Q02201 448 aa13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W TAF3Q12297 353 aa13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W IES3Q12345 250 aa13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W GSY1P23337 708 aa13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W CAP1P28495 268 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W SPC72P39723 622 aa13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W ICP55P40051 511 aa13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W USE1P53146 245 aa13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W MED1Q12321 566 aa13.41□□□□□ -0.26
SSA4YER103W THS1P04801 734 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SSA4YER103W MRM1P25270 412 aa13.4□□□□□ -0.26
SSA4YER103W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SSA4YER103W YDL057WQ07379 328 aa13.4□□□□□ -0.26
SSA4YER103W MSH5Q12175 901 aa13.4□□□□□ -0.26
SSA4YER103W GCR1P07261 785 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W URA4P20051 364 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W YBP1P38315 674 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W ORC6P38826 435 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W STB1P42845 420 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W PIP2P52960 996 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W DRN1P53255 507 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W YKR005CQ02203 525 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W MRP8P35719 219 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W HES1P35843 434 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W UBP15P50101 1230 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W ESBP6P53918 673 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W VHS3Q08438 674 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W ENT1Q12518 454 aa13.39□□□□□ -0.27
SSA4YER103W FMN1Q03778 218 aa13.38□□□□□ -0.27
SSA4YER103W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
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