RNA–Protein interactions for RNA: YAL003W

EFB1, Transcript of Translation elongation factor 1 beta, yeast

Gene EFB1, Length 621 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EFB1	YAL003W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	TVP38	P36164	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	BRL1	P38770	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	YEL076C	P39971	216 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	HUL5	P53119	910 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	SEC5	P89102	971 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	SLD5	Q03406	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	LCD1	Q04377	747 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	ADY4	Q05955	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	YLH47	Q06493	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	SRD1	P09007	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
EFB1	YAL003W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	TIM23	P32897	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	SIP3	P38717	1229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	BCD1	P38772	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	FYV10	P40492	516 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	FIS1	P40515	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	VPS53	P47061	822 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	NCS6	P53088	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	DIP5	P53388	608 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	PGA2	P53903	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	CRD1	Q07560	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	PSR2	Q07949	397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	MET7	Q08645	548 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	TRM11	Q12463	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	MRPL10	P36520	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	CTR1	P49573	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	GUP1	P53154	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	MDR1	P53258	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	CUR1	Q06469	252 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	ICL2	Q12031	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	YUR1	P26725	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	PIH1	P38768	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	YGR237C	P50089	785 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	VID30	P53076	958 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	SVF1	Q05515	481 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	TLG2	Q08144	397 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	TCO89	Q08921	799 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	AFT2	Q08957	416 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	PCK1	P10963	549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	POX1	P13711	748 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	SAC7	P17121	654 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	MIC60	P36112	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	UBP13	P38187	747 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	PSF2	P40359	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	AIM21	P40563	679 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	AVT1	P47082	602 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	SKP1	P52286	194 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	MTO1	P53070	669 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	ROD1	Q02805	837 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	WAR1	Q03631	944 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	YML020W	Q03722	664 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	COG4	Q06096	861 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFB1	YAL003W	MOT1	P32333	1867 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	OM45	P16547	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	MRC1	P25588	1096 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	COT1	P32798	439 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	VPS35	P34110	944 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	ATG19	P35193	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SAP190	P36123	1033 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	GPT2	P36148	743 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	YKR073C	P36153	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	PPS1	P38148	807 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	PSY4	P38193	441 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	HUL4	P40985	892 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SSL2	Q00578	843 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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