RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data1.01□□□□□ -2.25not detected
tF(GAA)BtF(GAA)B PMT3P47190 753 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B COQ5P49017 307 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B PSP1P50896 841 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B PIP2P52960 996 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B MAL11P53048 616 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SUN4P53616 420 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B TBF1Q02457 562 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B RPN4Q03465 531 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B INP2Q03824 705 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B TAP42Q04372 366 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B TMA64Q04600 565 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B NSE3Q05541 303 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B FAR10Q06001 478 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B HIM1Q06674 414 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B YOL073CQ08232 322 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B YDL211CQ12121 372 aa1.01□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B HAP4P14064 554 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B NUP1P20676 1076 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SGV1P23293 657 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B PRE8P23639 250 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B CHS3P29465 1165 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B PTC3P34221 468 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B AKL1P38080 1108 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B FTH1P38310 465 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B TIF5P38431 405 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B AXL2P38928 823 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B OSW5P40219 148 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B YIR042CP40586 236 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B CEP3P40969 608 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B IKS1P47042 667 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B MRX6P48564 524 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B NUT1P53114 1132 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B HRQ1Q05549 1077 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SDH5Q08230 162 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B HER1Q12276 1246 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B PCD1Q12524 340 aa1□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B CIT1P00890 479 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B AI3P03877 415 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B RAD3P06839 778 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B ADE3P07245 946 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B ABF1P14164 731 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B KGD2P19262 463 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B RDS2P19541 446 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B FPR1P20081 114 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B PRI2P20457 528 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SEC62P21825 274 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SRM1P21827 482 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SCJ1P25303 377 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B ADH7P25377 361 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B CWP1P28319 239 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B BIO2P32451 375 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B RRN6P32786 894 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B TTI1P36097 1038 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B BCH2P36122 765 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SOL2P37262 315 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B HMT1P38074 348 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B UBX7P38349 436 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B DSS1P39112 969 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B DSN1P40568 576 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B IES1P43579 692 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SAD1P43589 448 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B JHD2P47156 728 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B BPL1P48445 690 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B YNR065CP53751 1116 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B TDA7P53882 636 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SWS2P53937 143 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SLG1P54867 378 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B YMR187CQ03236 431 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B TRM82Q03774 444 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B VHS1Q03785 461 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B YML096WQ04489 525 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B YFT2Q06676 274 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B AAD4Q07747 329 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B ESC8Q08119 714 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B PUS1Q12211 544 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SKM1Q12469 655 aa0.99□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B REC107P21651 314 aa0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B UBC1P21734 215 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B PRO3P32263 286 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B UBP11P36026 717 aa0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B PET10P36139 283 aa0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B PGM2P37012 569 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B QNS1P38795 714 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B YAP1801P38856 637 aa0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SAK1P38990 1142 aa0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B SAH1P39954 449 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B UBP7P40453 1071 aa0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B VID28P40547 921 aa0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B AIM23P47015 356 aa0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B UBP15P50101 1230 aa0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B ITC1P53125 1264 aa0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B YGL081WP53156 320 aa0.98□□□□□ -2.25
tF(GAA)BtF(GAA)B NNF2P53253 936 aa0.98□□□□□ -2.25
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