RNA–Protein interactions for RNA: YOR057W

SGT1, Transcript of Cochaperone protein, yeast

Gene SGT1, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SGT1	YOR057W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	EXG2	P52911	562 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	NCS6	P53088	359 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	ATG19	P35193	415 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	ALR2	P43553	858 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	SPO75	Q07798	868 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	NUP159	P40477	1460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	ERT1	P38140	529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	IOC3	P43596	787 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	NPC2	Q12408	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SGT1	YOR057W	YBR284W	P38150	797 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	SUN4	P53616	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	LCD1	Q04377	747 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	EAF1	Q06337	982 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	UBX5	Q06682	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	PUS9	Q12069	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	RAD4	P14736	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	CDC11	P32458	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	TOK1	P40310	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	MSE1	P48525	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	UPC2	Q12151	913 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	PNS1	Q12412	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	NUP170	P38181	1502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	ARE1	P25628	610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	STE13	P33894	931 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	ERP6	P53198	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	SED4	P25365	1065 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	KAR4	P25583	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	RPD3	P32561	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	STE14	P32584	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	REC104	P33323	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	VPS30	Q02948	557 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	LAS17	Q12446	633 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	SCT1	P32784	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	MSS4	P38994	779 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	AIM21	P40563	679 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	ENB1	Q08299	606 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	GUP2	Q08929	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	SIN3	P22579	1536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	PET10	P36139	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	TIM54	P47045	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
SGT1	YOR057W	KIN4	Q01919	800 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	AIM39	Q08223	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SGT1	YOR057W	CIT1	P00890	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	FBP1	P09201	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	CEP3	P40969	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	SLI1	P53304	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TOP3	P13099	656 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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