RNA–Protein interactions for RNA: YJR143C

PMT4, Transcript of Protein O-mannosyltransferase, yeast

Gene PMT4, Length 2,289 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMT4	YJR143C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	MIH1	P23748	554 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	ORC2	P32833	620 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	MKS1	P34072	584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	DUN1	P39009	513 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	RIC1	P40395	1056 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	MPH1	P40562	993 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	AXL1	P40851	1208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	RMD8	P43620	662 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	YGR153W	P48238	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	SKY1	Q03656	742 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	TAH18	Q12181	623 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	PGS1	P25578	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	DID4	P36108	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	AXL2	P38928	823 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	YEL068C	P39977	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	HLR1	Q04429	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	HOG1	P32485	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	KAP122	P32767	1081 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	EXO5	P38289	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	EMP65	P40085	556 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	JEM1	P40358	645 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	YIL166C	P40445	542 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	YIL165C	P40446	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	IMA5	P40884	581 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	TEP1	P53916	434 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMT4	YJR143C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	HOP1	P20050	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	NPL6	P32832	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	MTH1	P35198	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	SPC72	P39723	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TFC6	Q06339	672 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YPR015C	Q12531	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
PMT4	YJR143C	RED1	P14291	827 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ATP12	P22135	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	POL4	P25615	582 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	FUN30	P31380	1131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ESL2	P36168	1195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	MCM7	P38132	845 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	DJP1	P40564	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	VPS53	P47061	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	HOT1	Q03213	719 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ESC8	Q08119	714 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	GUP2	Q08929	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	MSH1	P25846	959 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	SEG2	P34250	1132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	BYE1	P36106	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	CCZ1	P38273	704 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	RGA1	P39083	1007 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	MDE1	P47095	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	COG8	Q04632	607 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	DFG5	Q05031	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ENA1	P13587	1091 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	MLS1	P30952	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	LTP1	P40347	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	RAD26	P40352	1085 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TRM8	Q12009	286 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	CBF2	P32504	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	FAT1	P38225	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YDR344C	Q05510	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	EST2	Q06163	884 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ARP7	Q12406	477 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	SLA1	P32790	1244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	AFG2	P32794	780 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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