RNA–Protein interactions for RNA: YJL075C

APQ13, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene APQ13, Length 417 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APQ13	YJL075C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	CTF8	P38877	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	TPO2	P53283	614 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	PPM2	Q08282	695 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	ERG4	P25340	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	REC104	P33323	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	KTR4	P38131	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	ALR2	P43553	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	PET10	P36139	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	YBR284W	P38150	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	SUL1	P38359	859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	UBX5	Q06682	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	CTF13	P35203	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
APQ13	YJL075C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	PEX19	Q07418	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	ENV7	Q12003	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APQ13	YJL075C	TOP3	P13099	656 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	CEP3	P40969	608 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	VPS30	Q02948	557 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	EAF1	Q06337	982 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	CDC11	P32458	415 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	ERP6	P53198	216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	YHR078W	P38799	552 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	MRPS35	P53292	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	RNT1	Q02555	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	OMS1	Q06668	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	SPO75	Q07798	868 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	TRM11	Q12463	433 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	ALG7	P07286	448 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	RAD4	P14736	754 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	YPT53	P36019	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	MUK1	Q02866	612 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	TMN2	Q04562	672 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	STB4	P50104	949 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	ASI2	P53895	289 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	TAF8	Q03750	510 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	ARE1	P25628	610 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
APQ13	YJL075C	UBA2	P52488	636 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	MCH5	Q08777	521 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	SWM1	Q12379	170 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APQ13	YJL075C	CIT1	P00890	479 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	RPP1	P38786	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	GYP8	P43570	497 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	FRE5	Q08908	694 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	ACF2	Q12168	779 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	SCT1	P32784	759 aa		4.76	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	EMC3	P36039	253 aa		4.76	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	BET3	P36149	193 aa		4.76	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	ELO3	P40319	345 aa		4.76	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	VHR1	P40522	640 aa		4.76	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.76	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	DAL7	P21826	554 aa		4.75	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	FKH2	P41813	862 aa		4.75	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	TAD1	P53065	400 aa		4.75	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	DLT1	Q04216	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	ADY4	Q05955	493 aa		4.75	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	GPR1	Q12361	961 aa		4.75	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	MET3	P08536	511 aa		4.74	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	YCL002C	P25565	263 aa		4.74	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	PPS1	P38148	807 aa		4.74	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	YBR053C	P38235	358 aa		4.74	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	TIM54	P47045	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	PUS2	P53167	370 aa		4.74	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.74	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	IRC10	Q08118	586 aa		4.74	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	FLC1	Q08967	793 aa		4.74	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	THI21	Q08975	551 aa		4.74	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.74	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	MTH1	P35198	433 aa		4.73	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	YJL049W	P47048	450 aa		4.73	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	NIT3	P49954	291 aa		4.73	□□□□□ -1.65
APQ13	YJL075C	MUP1	P50276	574 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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