RNA–Protein interactions for RNA: YHR038W

RRF1, Transcript of Mitochondrial ribosome recycling factor, yeast

Gene RRF1, Length 693 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRF1	YHR038W	YIL166C	P40445	542 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	SDP1	P40479	209 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	YJR107W	P47145	328 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	CRR1	Q05790	422 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	POL32	P47110	350 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	SCS3	P53012	380 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	SWM1	Q12379	170 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	CDC34	P14682	295 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	STE13	P33894	931 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	YJL163C	P46996	555 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	YBR053C	P38235	358 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	RPP1	P38786	293 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	MBP1	P39678	833 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	YGR053C	P53234	283 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	SPO20	Q04359	397 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
RRF1	YHR038W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	YKE2	P52553	114 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	NPP1	P25353	742 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	SLD2	P34252	453 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	CTF8	P38877	133 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	GAT1	P43574	510 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	RIA1	P53893	1110 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RRF1	YHR038W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	MET10	P39692	1035 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	TAF7	Q05021	590 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	IRC13	Q08630	104 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	VPS30	Q02948	557 aa		4.31	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	EMP70	P32802	667 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	PET112	P33893	541 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	PUS2	P53167	370 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	SPO11	P23179	398 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	AFR1	P33304	620 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	VHR1	P40522	640 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	DMC1	P25453	334 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	ORC2	P32833	620 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RRF1	YHR038W	CEP3	P40969	608 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.27	□□□□□ -1.73	not detected
RRF1	YHR038W	AMA1	P50082	593 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	YHR078W	P38799	552 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	YJL206C	P39529	758 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	DAM1	P53267	343 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	RMD1	Q03441	430 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	RIM13	Q03792	727 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	SGO1	Q08490	590 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	YUR1	P26725	428 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	PPH3	P32345	308 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	HDA1	P53973	706 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	SSL2	Q00578	843 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	ASM4	Q05166	528 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	TAF3	Q12297	353 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	ERT1	P38140	529 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	ASI2	P53895	289 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	YEL020C	P39994	560 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	FMP52	P40008	231 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	YIR042C	P40586	236 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	TEL2	P53038	688 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	PKH1	Q03407	766 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRF1	YHR038W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	YRO2	P38079	344 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	BCD1	P38772	366 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	ADE8	P04161	214 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	NRG1	Q03125	231 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	CLN2	P20438	545 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	AGP1	P25376	633 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	ASF1	P32447	279 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	HOS4	P40480	1083 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	SEG1	Q04279	960 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	OSW1	Q08692	278 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	RGT2	Q12300	763 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.4 ms