RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C YBR184WP38299 523 aa3.27□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C SPF1P39986 1215 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C NNF1P47149 201 aa3.27□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C RNT1Q02555 471 aa3.27□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C YMR206WQ03695 313 aa3.27□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C LCD1Q04377 747 aa3.27□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C SWM1Q12379 170 aa3.27□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C STE14P32584 239 aa3.26□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C REC104P33323 182 aa3.26□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C ALR2P43553 858 aa3.26□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C PUS2P53167 370 aa3.26□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C OMS1Q06668 471 aa3.26□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C SPO75Q07798 868 aa3.26□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C MCH5Q08777 521 aa3.26□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C MET3P08536 511 aa3.25□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C STE5P32917 917 aa3.25□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C AFR1P33304 620 aa3.25□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C BRN1P38170 754 aa3.25□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C TOK1P40310 691 aa3.25□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C SDP1P40479 209 aa3.25□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C STU2P46675 888 aa3.25□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C BUL1P48524 976 aa3.25□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C EAF1Q06337 982 aa3.25□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C ACF2Q12168 779 aa3.25□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C YPR071WQ12346 211 aa3.25□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C GRX1P25373 110 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C URA1P28272 314 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C SEC21P32074 935 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C HBS1P32769 611 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C YBR284WP38150 797 aa3.24□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data3.24□□□□□ -1.89not detected
YFR056CYFR056C YKR011CQ02209 353 aa3.24□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C YOL098CQ12496 1037 aa3.24□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C PPR1P07272 904 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C ALG7P07286 448 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C FBP1P09201 348 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C ARE1P25628 610 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C SPC42P36094 363 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C ERT1P38140 529 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C CTF8P38877 133 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C PFD1P46988 109 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C NIT3P49954 291 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C STB4P50104 949 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C ERP6P53198 216 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C UTP8P53276 713 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C NAN1Q02931 896 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C DLT1Q04216 342 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C FMP25Q08023 583 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C OSH2Q12451 1283 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C TRM11Q12463 433 aa3.23□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C MPH2P0CD99 609 aa3.22□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C CTF13P35203 478 aa3.22□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C YPT53P36019 220 aa3.22□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C YHR078WP38799 552 aa3.22□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C SLU7Q02775 382 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C BUL2Q03758 920 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C UBX5Q06682 500 aa3.22□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C FRE5Q08908 694 aa3.22□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C NGG1P32494 702 aa3.21□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C YKL091CP33324 310 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C PET10P36139 283 aa3.21□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C HDA1P53973 706 aa3.21□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C YML122CQ03207 126 aa3.21□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C PKH1Q03407 766 aa3.21□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C TMN2Q04562 672 aa3.21□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C CAF20P12962 161 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C MSD1P15179 658 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C CYS3P31373 394 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C PPG1P32838 368 aa3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C SAP190P36123 1033 aa3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C RPP1P38786 293 aa3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C PZF1P39933 429 aa3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C ELO3P40319 345 aa3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C VHR1P40522 640 aa3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C DAS1P47005 663 aa3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C RNH70P53331 553 aa3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C NOG2P53742 486 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C ERG5P54781 538 aa3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data3.2□□□□□ -1.9not detected
YFR056CYFR056C CRR1Q05790 422 aa3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C TRM13Q12383 476 aa3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C HBN1Q96VH4 193 aa3.2□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C TUB3P09734 445 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C HSP60P19882 572 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C HUL4P40985 892 aa3.19□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C FKH2P41813 862 aa3.19□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C DUS1P53759 423 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C MUK1Q02866 612 aa3.19□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C ENV7Q12003 364 aa3.19□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C CDC53Q12018 815 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C PRC1P00729 532 aa3.18□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C RAD4P14736 754 aa3.18□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C DAL7P21826 554 aa3.18□□□□□ -1.9
YFR056CYFR056C PPS1P38148 807 aa3.18□□□□□ -1.9
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