RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	VID30	P53076	958 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YPR204W	Q08995	1032 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ARG82	P07250	355 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PHO8	P11491	566 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	NUF2	P33895	451 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	LEM3	P42838	414 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	TOM22	P49334	152 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YLR297W	Q05899	129 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	AAD3	P25612	363 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YEL043W	P32618	956 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ADD66	P36040	267 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YGR125W	P53273	1036 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	COG6	P53959	839 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YKL100C	P34248	587 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	MSC7	P38694	644 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YER130C	P39959	443 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	NHP10	Q03435	203 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	TFC6	Q06339	672 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ROX1	P25042	368 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	MRC1	P25588	1096 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	STN1	P38960	494 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YJR054W	P47114	497 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SRM1	P21827	482 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	FBP26	P32604	452 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	TEL2	P53038	688 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YGR273C	P53329	174 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YML083C	Q04526	418 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	AAD4	Q07747	329 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	MCM16	Q12262	181 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	BRF1	P29056	596 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	IRE1	P32361	1115 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	JJJ3	P47138	172 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	FMS1	P50264	508 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ASI3	P53983	676 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SPO71	Q03868	1245 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	COS7	Q07788	383 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PDE1	P22434	369 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	CUL3	P53202	744 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.16	□□□□□ -1.58	not detected
DNF2	YDR093W	AIM33	Q04516	312 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	VPS38	Q05919	439 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	TOS4	Q06266	489 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	HOS1	Q12214	470 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	HES1	P35843	434 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	XDJ1	P39102	459 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	FTR1	P40088	404 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	INA22	P40576	216 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YOR111W	Q99210	232 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	HSE1	P38753	452 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	BDH2	P39713	417 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.16	□□□□□ -1.58	not detected
DNF2	YDR093W	CLN3	P13365	580 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	EUG1	P32474	517 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	MEI5	P32489	222 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	GRX7	P38068	203 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	HOS4	P40480	1083 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	NSE5	Q03718	556 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	APC5	Q08683	685 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	TGL5	Q12043	749 aa		5.16	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PMS1	P14242	873 aa		5.15	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	GUT1	P32190	709 aa		5.15	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	FUS1	P11710	512 aa		5.15	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SWI3	P32591	825 aa		5.15	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	APN2	P38207	520 aa		5.15	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	RSM7	P47150	247 aa		5.15	□□□□□ -1.58

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