RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE4	YDL105W	SIT1	P39980	628 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	IRR1	P40541	1150 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	MTH1	P35198	433 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	ALG7	P07286	448 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	FBP1	P09201	348 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE4	YDL105W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	AFR1	P33304	620 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	SPC42	P36094	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	SDP1	P40479	209 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	GND2	P53319	492 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	PEX19	Q07418	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	MUK1	Q02866	612 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	LCD1	Q04377	747 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	RPD3	P32561	433 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	CTF8	P38877	133 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	NNF1	P47149	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	ERG5	P54781	538 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	SWM1	Q12379	170 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	MET3	P08536	511 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	CDC11	P32458	415 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	REC104	P33323	182 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	CTF13	P35203	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	TRM11	Q12463	433 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	STE5	P32917	917 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	TOK1	P40310	691 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	SDS3	P40505	327 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	DAS1	P47005	663 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE4	YDL105W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	YBR184W	P38299	523 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	CEP3	P40969	608 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	YJL049W	P47048	450 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
NSE4	YDL105W	HDA1	P53973	706 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	DLT1	Q04216	342 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	TRM13	Q12383	476 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	ERT1	P38140	529 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	YHL017W	P38745	532 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	PFD1	P46988	109 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	FRE5	Q08908	694 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	YHR078W	P38799	552 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	ELO3	P40319	345 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	ALR2	P43553	858 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	PUS2	P53167	370 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
NSE4	YDL105W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	SPO75	Q07798	868 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	FMP25	Q08023	583 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	PPS1	P38148	807 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	YBR284W	P38150	797 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	RPP1	P38786	293 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	PET10	P36139	283 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	ERP6	P53198	216 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	ADY4	Q05955	493 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NSE4	YDL105W	RAD4	P14736	754 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	NGG1	P32494	702 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	PEX2	P32800	271 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	OCA5	P38738	679 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	VHR1	P40522	640 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	FKH2	P41813	862 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	NIT3	P49954	291 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	EAF1	Q06337	982 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	TIM54	P47045	478 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	AMA1	P50082	593 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	ASI2	P53895	289 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	PKH1	Q03407	766 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSE4	YDL105W	HOF1	Q05080	669 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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