RNA–Protein interactions for RNA: YBR293W

VBA2, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA2, Length 1,425 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA2	YBR293W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TAP42	Q04372	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	VAC14	Q06708	880 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ELG1	Q12050	791 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	PHM7	Q12252	991 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	NTE1	Q04958	1679 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	CDC8	P00572	216 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	VAN1	P23642	535 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	FPS1	P23900	669 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	KDX1	P36005	433 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	MRPL16	P38064	232 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	PSY4	P38193	441 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	UBX7	P38349	436 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YLF2	P38746	405 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	CCC2	P38995	1004 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	FMS1	P50264	508 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	PCL10	P53124	433 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	COG6	P53959	839 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	MGR3	Q04472	501 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	KAR5	Q04746	504 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YLH47	Q06493	454 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TMA16	Q08687	178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	GNT1	Q12096	491 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	RMP1	Q12530	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YPR089W	O13585	888 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ADH4	P10127	382 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	GAL2	P13181	574 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	HIR2	P32480	875 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	CBF2	P32504	956 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	MAL33	P38157	468 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YHL050C	P38721	697 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YHR219W	P38900	624 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SPC72	P39723	622 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YTA6	P40328	754 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	AXL1	P40851	1208 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	VTC2	P43585	828 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	HFM1	P51979	1187 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	MSH5	Q12175	901 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	APC2	Q12440	853 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA2	YBR293W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	ITR2	P30606	609 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SEC8	P32855	1065 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	ATO2	P32907	282 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	BUD2	P33314	1104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	NUP120	P35729	1037 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	PXL1	P36166	706 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
VBA2	YBR293W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	FES1	P38260	290 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	FZO1	P38297	855 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SMF1	P38925	575 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SAK1	P38990	1142 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SPO22	P40511	975 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	ENT3	P47160	408 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SGM1	P47166	707 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	FAR11	P53917	953 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	UFD2	P54860	961 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	SRT1	Q03175	343 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	BDF2	Q07442	638 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	STB3	Q12427	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	CYT1	P07143	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	VPH2	P32341	215 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VBA2	YBR293W	STE13	P33894	931 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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