RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000062829.8

Hoxa6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa6, Length 874 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cwc25Q9DBF7 416 aa21.52■■□□□ 1.04
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm7347D3YYI9 267 aa21.51■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Speer4aF8VPX6 267 aa21.51■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Usp48Q3V0C5 1052 aa21.51■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cyp7a1Q64505 503 aa21.51■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 GptQ8QZR5 496 aa21.51■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ehd4Q9EQP2 541 aa21.51■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Col24a1Q30D77 1733 aa21.51■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cyp2d11P24457 504 aa21.5■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccdc30Q8BVF4 654 aa21.5■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Arap2Q8BZ05 1703 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Znf609Q8BZ47 1413 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm6268A2A3U9 297 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Vsig10D3YX43 558 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Csf1rP09581 977 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fam213aQ9CYH2 218 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ank1Q02357 1862 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Setdb1O88974 1307 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 UtrnE9Q6R7 3430 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 PgfP49764 158 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pcsk7Q61139 770 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 CanxP35564 591 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Clca2Q8BG22 942 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Myh1Q5SX40 1942 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Igflr1Q3U4N7 345 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Dydc2Q9D3X8 139 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lrch1P62046 709 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Aplp1Q03157 653 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nup188Q6ZQH8 1759 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rbm46P86049 533 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zbtb38Q3LR78 1197 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 HellsQ60848 821 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ripor2Q80U16 1078 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Adarb2Q9JI20 745 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Myo3bQ1EG27 1305 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Scn9aQ62205 1984 aa21.43■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 EappQ5BU09 281 aa21.43■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ttc19Q8CC21 365 aa21.43■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Exoc6bA6H5Z3 810 aa21.42■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Oas2E9Q9A9 742 aa21.42■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trim34bJ3QNR8 485 aa21.42■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rps8P62242 208 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Btaf1E9QAE3 1848 aa21.41■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa21.41■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gpr101Q80T62 511 aa21.41■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trim26Q99PN3 545 aa21.41■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gja3Q64448 417 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Znf428Q8C1M2 176 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccdc60Q8C4J0 545 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kif2cQ922S8 721 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Myoz2Q9JJW5 264 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sall2Q9QX96 1004 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Glt1d1A4FUP9 346 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gas2l2Q5SSG4 860 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Best3Q6H1V1 669 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 NmiO35309 314 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Eif6O55135 245 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 BcanQ61361 883 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Map3k15A2AQW0 1331 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 SobpQ0P5V2 864 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Naa16Q9DBB4 864 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Slc4a9E9PUP3 929 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Chrna5Q2MKA5 467 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Map9Q3TRR0 646 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Psmd1Q3TXS7 953 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Greb1lB9EJV3 1913 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Dcdc2bF7BCK0 340 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 NfixP70257 488 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Bend3Q6PAL0 825 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Smc4Q8CG47 1286 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zfp646Q6NV66 1788 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Glis2Q8VDL9 521 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Heg1E9Q7X6 1337 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Eddm13E9Q7F5 164 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Slfn1Q9Z0I7 337 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lgr5Q9Z1P4 907 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mical3Q8CJ19 1993 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Bend4P86174 541 aa21.32■■□□□ 1
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tmco5bQ80X59 307 aa21.32■■□□□ 1
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Plekhg6Q8R0J1 787 aa21.32■■□□□ 1
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Dpp7Q9ET22 506 aa21.32■■□□□ 1
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gdf11Q9Z1W4 405 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.3 ms