Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47,87■■■■■ 5,25
Gdf11Q9Z1W4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44,41■■■■■ 4,7
Gdf11Q9Z1W4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,73■■■■■ 4,59
Gdf11Q9Z1W4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41,61■■■■■ 4,25
Gdf11Q9Z1W4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,55■■■■■ 4,24
Gdf11Q9Z1W4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,59■■■■■ 4,09
Gdf11Q9Z1W4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Gdf11Q9Z1W4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Gdf11Q9Z1W4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Gdf11Q9Z1W4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39,92■■■■□ 3,98
Gdf11Q9Z1W4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
Gdf11Q9Z1W4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,59■■■■□ 3,93
Gdf11Q9Z1W4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,85
Gdf11Q9Z1W4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38,94■■■■□ 3,82
Gdf11Q9Z1W4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Gdf11Q9Z1W4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38,62■■■■□ 3,77
Gdf11Q9Z1W4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,52■■■■□ 3,76
Gdf11Q9Z1W4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,41■■■■□ 3,74
Gdf11Q9Z1W4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,4■■■■□ 3,74
Gdf11Q9Z1W4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,32■■■■□ 3,72
Gdf11Q9Z1W4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Gdf11Q9Z1W4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Gdf11Q9Z1W4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,67
Gdf11Q9Z1W4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Gdf11Q9Z1W4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37,89■■■■□ 3,66
Gdf11Q9Z1W4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37,86■■■■□ 3,65
Gdf11Q9Z1W4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,8■■■■□ 3,64
Gdf11Q9Z1W4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Gdf11Q9Z1W4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Gdf11Q9Z1W4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Gdf11Q9Z1W4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Gdf11Q9Z1W4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Gdf11Q9Z1W4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,09■■■■□ 3,53
Gdf11Q9Z1W4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,08■■■■□ 3,53
Gdf11Q9Z1W4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Gdf11Q9Z1W4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Gdf11Q9Z1W4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Gdf11Q9Z1W4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Gdf11Q9Z1W4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,68■■■■□ 3,46
Gdf11Q9Z1W4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Gdf11Q9Z1W4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36,6■■■■□ 3,45
Gdf11Q9Z1W4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Gdf11Q9Z1W4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36,41■■■■□ 3,42
Gdf11Q9Z1W4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,36■■■■□ 3,41
Gdf11Q9Z1W4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Gdf11Q9Z1W4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Gdf11Q9Z1W4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,22■■■■□ 3,39
Gdf11Q9Z1W4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Gdf11Q9Z1W4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Gdf11Q9Z1W4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Gdf11Q9Z1W4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,87■■■■□ 3,33
Gdf11Q9Z1W4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,82■■■■□ 3,32
Gdf11Q9Z1W4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,81■■■■□ 3,32
Gdf11Q9Z1W4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Gdf11Q9Z1W4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Gdf11Q9Z1W4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,74■■■■□ 3,31
Gdf11Q9Z1W4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,66■■■■□ 3,3
Gdf11Q9Z1W4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Gdf11Q9Z1W4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,61■■■■□ 3,29
Gdf11Q9Z1W4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,56■■■■□ 3,28
Gdf11Q9Z1W4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Gdf11Q9Z1W4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Gdf11Q9Z1W4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Gdf11Q9Z1W4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,44■■■■□ 3,26
Gdf11Q9Z1W4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,43■■■■□ 3,26
Gdf11Q9Z1W4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35,41■■■■□ 3,26
Gdf11Q9Z1W4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Gdf11Q9Z1W4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Gdf11Q9Z1W4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Gdf11Q9Z1W4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,37■■■■□ 3,25
Gdf11Q9Z1W4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Gdf11Q9Z1W4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Gdf11Q9Z1W4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Gdf11Q9Z1W4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Gdf11Q9Z1W4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Gdf11Q9Z1W4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Gdf11Q9Z1W4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Gdf11Q9Z1W4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,07■■■■□ 3,2
Gdf11Q9Z1W4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Gdf11Q9Z1W4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Gdf11Q9Z1W4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Gdf11Q9Z1W4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Gdf11Q9Z1W4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Gdf11Q9Z1W4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Gdf11Q9Z1W4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Gdf11Q9Z1W4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Gdf11Q9Z1W4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,76■■■■□ 3,16
Gdf11Q9Z1W4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Gdf11Q9Z1W4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,65■■■■□ 3,14
Gdf11Q9Z1W4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Gdf11Q9Z1W4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Gdf11Q9Z1W4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Gdf11Q9Z1W4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,54■■■■□ 3,12
Gdf11Q9Z1W4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Gdf11Q9Z1W4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,11
Gdf11Q9Z1W4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Gdf11Q9Z1W4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Gdf11Q9Z1W4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Gdf11Q9Z1W4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Gdf11Q9Z1W4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,9 ms