Protein–RNA interactions for Protein: P86174

Bend4, BEN domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend4P86174 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.6■■■■■ 5.21
Bend4P86174 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Bend4P86174 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Bend4P86174 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
Bend4P86174 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
Bend4P86174 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Bend4P86174 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Bend4P86174 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Bend4P86174 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Bend4P86174 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Bend4P86174 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Bend4P86174 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Bend4P86174 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Bend4P86174 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Bend4P86174 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Bend4P86174 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Bend4P86174 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Bend4P86174 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Bend4P86174 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Bend4P86174 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Bend4P86174 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Bend4P86174 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Bend4P86174 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Bend4P86174 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Bend4P86174 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Bend4P86174 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Bend4P86174 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Bend4P86174 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Bend4P86174 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Bend4P86174 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Bend4P86174 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Bend4P86174 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Bend4P86174 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Bend4P86174 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Bend4P86174 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Bend4P86174 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Bend4P86174 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Bend4P86174 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Bend4P86174 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Bend4P86174 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Bend4P86174 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Bend4P86174 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Bend4P86174 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Bend4P86174 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Bend4P86174 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Bend4P86174 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Bend4P86174 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Bend4P86174 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Bend4P86174 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Bend4P86174 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Bend4P86174 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Bend4P86174 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Bend4P86174 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Bend4P86174 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Bend4P86174 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Bend4P86174 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Bend4P86174 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Bend4P86174 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Bend4P86174 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Bend4P86174 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Bend4P86174 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Bend4P86174 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Bend4P86174 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Bend4P86174 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Bend4P86174 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Bend4P86174 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Bend4P86174 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Bend4P86174 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Bend4P86174 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Bend4P86174 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Bend4P86174 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Bend4P86174 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Bend4P86174 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Bend4P86174 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Bend4P86174 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Bend4P86174 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Bend4P86174 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Bend4P86174 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Bend4P86174 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Bend4P86174 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Bend4P86174 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Bend4P86174 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Bend4P86174 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Bend4P86174 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Bend4P86174 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Bend4P86174 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Bend4P86174 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Bend4P86174 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Bend4P86174 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Bend4P86174 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Bend4P86174 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Bend4P86174 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
Bend4P86174 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Bend4P86174 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Bend4P86174 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Bend4P86174 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Bend4P86174 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Bend4P86174 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Bend4P86174 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Bend4P86174 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms