RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000062829.8

Hoxa6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa6, Length 874 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa38.7■■■■□ 3.79
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Abcc9P70170 1546 aa36.84■■■■□ 3.49
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 ScribQ80U72 1612 aa35.65■■■■□ 3.3
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 NacadQ5SWP3 1504 aa34.65■■■■□ 3.14
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kdm5dQ62240 1548 aa34.45■■■■□ 3.11
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Dcaf1Q80TR8 1506 aa34.01■■■■□ 3.04
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sycp2Q9CUU3 1500 aa33.95■■■■□ 3.03
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 BicraF8VPZ9 1578 aa33.46■■■□□ 2.95
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa33.17■■■□□ 2.9
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Crybg2B7ZCC2 1516 aa32.82■■■□□ 2.85
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rhox8Q6VSS7 320 aa32.76■■■□□ 2.83
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccdc180J3QNE4 1664 aa32.75■■■□□ 2.83
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Baz1aO88379 1555 aa32.73■■■□□ 2.83
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ercc6F8VPZ5 1481 aa31.92■■■□□ 2.7
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Smarca2Q6DIC0 1577 aa31.89■■■□□ 2.7
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa31.86■■■□□ 2.69
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa31.74■■■□□ 2.67
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa31.72■■■□□ 2.67
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fam135aQ6NS59 1506 aa31.63■■■□□ 2.65
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Wdr62Q3U3T8 1523 aa31.52■■■□□ 2.64
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Frmpd1A2AKB4 1549 aa31.5■■■□□ 2.63
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Baz1bQ9Z277 1479 aa31.46■■■□□ 2.63
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ubl4bQ9CQ84 188 aa31.23■■■□□ 2.59
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rtl1Q7M732 1744 aa30.98■■■□□ 2.55
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa30.93■■■□□ 2.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Unc13aQ4KUS2 1712 aa30.93■■■□□ 2.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mrc2Q64449 1479 aa30.92■■■□□ 2.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Synj1Q8CHC4 1574 aa30.84■■■□□ 2.53
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa30.73■■■□□ 2.51
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trim41Q5NCC3 630 aa30.4■■■□□ 2.46
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cux2P70298 1426 aa30.36■■■□□ 2.45
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kif15Q6P9L6 1387 aa30.33■■■□□ 2.45
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa30.18■■■□□ 2.42
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lamc3Q9R0B6 1581 aa30.15■■■□□ 2.42
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Dnajc5P60904 198 aa30.12■■■□□ 2.41
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kif21aQ9QXL2 1672 aa30.04■■■□□ 2.4
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cep164Q5DU05 1446 aa29.96■■■□□ 2.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccdc18Q640L5 1455 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Golga3P55937 1487 aa29.71■■■□□ 2.35
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Top2bQ64511 1612 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Shroom2A2ALU4 1481 aa29.63■■■□□ 2.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Plb1Q3TTY0 1478 aa29.62■■■□□ 2.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cngb1E1AZ71 1325 aa29.57■■■□□ 2.32
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Camsap1A2AHC3 1581 aa29.53■■■□□ 2.32
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Crocc2F6XLV1 1638 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fmn1Q05860 1466 aa29.43■■■□□ 2.3
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ift140E9PY46 1464 aa29.41■■■□□ 2.3
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Duox2A2AQ99 1517 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rusc2Q80U22 1514 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Col17a1Q07563 1470 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Grin2bQ01097 1482 aa29.17■■■□□ 2.26
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Disp1Q3TDN0 1521 aa29.14■■■□□ 2.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Efcab5A0JP43 1406 aa29.11■■■□□ 2.25
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Samd9lQ69Z37 1561 aa28.92■■■□□ 2.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Setd1bQ8CFT2 1985 aa28.89■■■□□ 2.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 NrkQ9R0G8 1455 aa28.85■■■□□ 2.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rad54l2Q99NG0 1466 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa28.78■■■□□ 2.2
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fgd6Q69ZL1 1399 aa28.76■■■□□ 2.2
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Magi3Q9EQJ9 1476 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Shroom4Q1W617 1475 aa28.64■■■□□ 2.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Chic1Q8CBW7 227 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 PtprkP35822 1457 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gpatch8A2A6A1 1505 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm156Q58A37 223 aa28.54■■■□□ 2.16
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Hoxa6-201ENSMUST00000062829 CadpsQ80TJ1 1355 aa28.49■■■□□ 2.15
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