RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data2.86□□□□□ -1.95not detected
HDA3YPR179C OSW2Q12202 724 aa2.86□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C RPC82P32349 654 aa2.85□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C MSS4P38994 779 aa2.85□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C KRI1P42846 591 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C YKE2P52553 114 aa2.85□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C YGR012WP53206 393 aa2.85□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C OPI10Q08202 246 aa2.85□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C YKL069WP36088 180 aa2.85□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C VBA5P36172 582 aa2.85□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C MBP1P39678 833 aa2.85□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C GYP7P48365 746 aa2.85□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C KIN4Q01919 800 aa2.85□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C KCS1Q12494 1050 aa2.85□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C SPE1P08432 466 aa2.84□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C AFR1P33304 620 aa2.84□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C YKR078WP36158 585 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C NCS6P53088 359 aa2.84□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C SNU71P53207 620 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C HSF1P10961 833 aa2.83□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C SFB2P53953 876 aa2.83□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C SRP1Q02821 542 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C ENB1Q08299 606 aa2.83□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C FAL1Q12099 399 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C LAS17Q12446 633 aa2.83□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C SRP101P32916 621 aa2.83□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C ATG19P35193 415 aa2.83□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C TSL1P38427 1098 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C SAH1P39954 449 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C MAD1P40957 749 aa2.83□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C BUL2Q03758 920 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C ENA1P13587 1091 aa2.82□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C PFK1P16861 987 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C NPP1P25353 742 aa2.82□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C SIT1P39980 628 aa2.82□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C BUL1P48524 976 aa2.82□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C ENA2Q01896 1091 aa2.82□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C AIM39Q08223 395 aa2.82□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C ENA5Q12691 1091 aa2.82□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C FBP1P09201 348 aa2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C STE14P32584 239 aa2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C MRP8P35719 219 aa2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C OAR1P35731 278 aa2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C PAM1P37304 830 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C DUS3Q06053 668 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C GUP2Q08929 609 aa2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C UPC2Q12151 913 aa2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C STE5P32917 917 aa2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C MOH1P38191 138 aa2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C PBY1P38254 753 aa2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C CCC2P38995 1004 aa2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C SPF1P39986 1215 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C YER158CP40095 573 aa2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C PSP2P50109 593 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C NPC2Q12408 173 aa2.81□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C HRR25P29295 494 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C HBS1P32769 611 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C PFD1P46988 109 aa2.8□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C NOP7P53261 605 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C CWC24P53769 259 aa2.8□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C SLU7Q02775 382 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C WHI4Q07655 649 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C PPM2Q08282 695 aa2.8□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C PRI2P20457 528 aa2.8□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C KAR4P25583 335 aa2.8□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C IRR1P40541 1150 aa2.8□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C CDC48P25694 835 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C VAC8P39968 578 aa2.79□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C RAI1P53063 387 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C ALD6P54115 500 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C ERG5P54781 538 aa2.79□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C YDR306CQ06640 478 aa2.78□□□□□ -1.96
HDA3YPR179C EFT1P32324 842 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C STE13P33894 931 aa2.78□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C KTR4P38131 464 aa2.78□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C UTP8P53276 713 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C ADE8P04161 214 aa2.77□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C YBR184WP38299 523 aa2.77□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C YML122CQ03207 126 aa2.77□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C FMP25Q08023 583 aa2.77□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C NOT3P06102 836 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C TRP4P07285 380 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C TDA5Q06417 326 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C PRP9P19736 530 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C PPH3P32345 308 aa2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C AAR2P32357 355 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C CTF8P38877 133 aa2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C TOK1P40310 691 aa2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C HDA1P53973 706 aa2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C LCD1Q04377 747 aa2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C YLR040CQ07988 224 aa2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C YOL073CQ08232 322 aa2.76□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C SED4P25365 1065 aa2.75□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C YRO2P38079 344 aa2.75□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C ERT1P38140 529 aa2.75□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C SDP1P40479 209 aa2.75□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C CCM1P48237 864 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
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