RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	HRQ1	Q05549	1077 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	ICT1	Q12385	394 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	CYC8	P14922	966 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	PPZ2	P33329	710 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	MDM38	Q08179	573 aa		3.3	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	PPS1	P38148	807 aa		3.29	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	GIC1	P38785	314 aa		3.29	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	IMO32	P53219	342 aa		3.29	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	ERG5	P54781	538 aa		3.29	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	HOF1	Q05080	669 aa		3.29	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	UPC2	Q12151	913 aa		3.29	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	FLO10	P36170	1169 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	GEF1	P37020	779 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	NPP2	P39997	493 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	SRT1	Q03175	343 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	YPL066W	Q12194	479 aa		3.28	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	STE14	P32584	239 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	TMT1	P32643	299 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	TDP1	P38319	544 aa		3.27	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	ATG19	P35193	415 aa		3.26	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	MCM2	P29469	868 aa		3.25	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	FUN30	P31380	1131 aa		3.25	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	SFB2	P53953	876 aa		3.25	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	COQ11	Q05892	277 aa		3.25	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	THI7	Q05998	598 aa		3.24	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	FRE5	Q08908	694 aa		3.24	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	YLL058W	Q12198	575 aa		3.24	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	SED4	P25365	1065 aa		3.23	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	RAD27	P26793	382 aa		3.23	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	TAH11	P47112	604 aa		3.23	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.23	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	INO1	P11986	533 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	YHL017W	P38745	532 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BLI1	YKL061W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	YGL176C	P46945	554 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	GLO1	P50107	326 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	SPR28	Q04921	423 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	RTT10	Q08924	1013 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	LYP1	P32487	611 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	IPL1	P38991	367 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.2	□□□□□ -1.9	not detected
BLI1	YKL061W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	ARO10	Q06408	635 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	PEX19	Q07418	342 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	ELO3	P40319	345 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	DAS1	P47005	663 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	SEC5	P89102	971 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	ADY4	Q05955	493 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	DUT1	P33317	147 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	YKL107W	P34251	309 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	EEB1	Q02891	456 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	RKM4	Q12504	494 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	MET3	P08536	511 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	CTF13	P35203	478 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	PCL5	P38794	229 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BLI1	YKL061W	FYV10	P40492	516 aa		3.15	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	SCS3	P53012	380 aa		3.15	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	TYW3	P53177	273 aa		3.15	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	DLT1	Q04216	342 aa		3.15	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	YPR196W	Q06595	470 aa		3.15	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	ADY2	P25613	283 aa		3.14	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	MUP1	P50276	574 aa		3.14	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	MRPS35	P53292	345 aa		3.14	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	ESC2	Q06340	456 aa		3.14	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	CDC43	P18898	376 aa		3.13	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	KIN3	P22209	435 aa		3.13	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	SEC20	P28791	383 aa		3.13	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	FKH2	P41813	862 aa		3.13	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	RPC82	P32349	654 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	YIL166C	P40445	542 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	RPD3	P32561	433 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	SDP1	P40479	209 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	GYP7	P48365	746 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	CRR1	Q05790	422 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	TRM11	Q12463	433 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BLI1	YKL061W	FBP1	P09201	348 aa		3.1	□□□□□ -1.91

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