RNA–Protein interactions for RNA: YJR128W

YJR128W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJR128W, Length 360 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR128W	YJR128W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
YJR128W	YJR128W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJR128W	YJR128W	COQ2	P32378	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	DOM34	P33309	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	YHL012W	P38709	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	SFP1	P32432	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	SIT1	P39980	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	PRY1	P47032	299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	RSB1	Q08417	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	PHM7	Q12252	991 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	PRO1	P32264	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	MDL2	P33311	773 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	UGA2	P38067	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	YRO2	P38079	344 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	YBR284W	P38150	797 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	MXR1	P40029	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	YFL066C	P43538	392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	RTA1	P53047	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	YGL081W	P53156	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	LCD1	Q04377	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	SNT2	P53127	1403 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	GSY1	P23337	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	MSH2	P25847	964 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	PET10	P36139	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	BET3	P36149	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	PIK1	P39104	1066 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	RCM1	P53972	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	YVC1	Q12324	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	CHS2	P14180	963 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	SLA2	P33338	968 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	SAF1	P38352	637 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	UGO1	Q03327	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	BAP2	P38084	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	GDH3	P39708	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	YJR142W	P47173	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	EAR1	Q03212	550 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJR128W	YJR128W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
YJR128W	YJR128W	SNF5	P18480	905 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	SRM1	P21827	482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	PEX6	P33760	1030 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	MDJ1	P35191	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	RRT14	P40470	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	ALG2	P43636	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	NTG2	Q08214	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	BI4	P03879	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	TOP3	P13099	656 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	TSR4	P25040	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	REC104	P33323	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	DSS1	P39112	969 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	NIT3	P49954	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	TRE1	Q08919	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	PDR10	P51533	1564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	BUD3	P25558	1636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
YJR128W	YJR128W	SAM35	P14693	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	AIM26	P32858	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	KAE1	P36132	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	TOK1	P40310	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	YFL054C	P43549	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	RSC58	Q07979	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	MDM38	Q08179	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	SPS1	P08458	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	RAD53	P22216	821 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	FUN30	P31380	1131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	ICP55	P40051	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	YER158C	P40095	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR128W	YJR128W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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