RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	YGR053C	P53234	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	RAD53	P22216	821 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	ENB1	Q08299	606 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	CLN2	P20438	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	NPC2	Q12408	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	GUP2	Q08929	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	NCS6	P53088	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	AGP1	P25376	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	ESC2	Q06340	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	OAR1	P35731	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	GYP7	P48365	746 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYS1	YJL004C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	YER158C	P40095	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	PPM2	Q08282	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	KAR4	P25583	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	YPT53	P36019	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	MAD1	P40957	749 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	KTR4	P38131	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	MOH1	P38191	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	MBP1	P39678	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	NPP2	P39997	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	UBA2	P52488	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	CWC24	P53769	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	SFB2	P53953	876 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	SVF1	Q05515	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	SED4	P25365	1065 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
SYS1	YJL004C	SHE9	Q04172	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	UPC2	Q12151	913 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	TPO2	P53283	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	PIN2	Q12057	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	LAS17	Q12446	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	PPH3	P32345	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	SCT1	P32784	759 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	SUL1	P38359	859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	VPS30	Q02948	557 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	VPS16	Q03308	798 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	VBA5	P36172	582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	BUL1	P48524	976 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	OPI10	Q08202	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYS1	YJL004C	ADE8	P04161	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	ERG4	P25340	473 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	MRP8	P35719	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	OMS1	Q06668	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	STE14	P32584	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	YKE2	P52553	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	TIM44	Q01852	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	PBY1	P38254	753 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	RNT1	Q02555	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	MCH5	Q08777	521 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	STE13	P33894	931 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	SIT1	P39980	628 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	STU2	P46675	888 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	ACF2	Q12168	779 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	YRO2	P38079	344 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	PRI2	P20457	528 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	NPP1	P25353	742 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
SYS1	YJL004C	YML122C	Q03207	126 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	PEX19	Q07418	342 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYS1	YJL004C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	YKL069W	P36088	180 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	SDP1	P40479	209 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	IRR1	P40541	1150 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	ALG7	P07286	448 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	FBP1	P09201	348 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	AFR1	P33304	620 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	STB4	P50104	949 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	TMN2	Q04562	672 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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