RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	LDH1	P38139	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	YBR284W	P38150	797 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	APM2	P38700	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	POP2	P39008	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	SSN3	P39073	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	NTA1	P40354	457 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	ENT1	Q12518	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLX8	YER116C	CDC9	P04819	755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	MSS18	P08593	268 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	INO1	P11986	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	ACE2	P21192	770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SLA1	P32790	1244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SPC29	P33419	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	PAN5	P38787	379 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	MAM1	P40065	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SGD1	Q06132	899 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	HDA2	Q06629	674 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	LAP2	Q10740	671 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	RMP1	Q12530	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SRD1	P09007	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	MRP7	P12687	371 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	RGP1	P16664	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SPO16	P17122	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	MSN1	P22148	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	RER1	P25560	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	PGS1	P25578	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YKL100C	P34248	587 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SCD5	P34758	872 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	BIT2	P38346	545 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	NSG2	P53898	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	RSC58	Q07979	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	PGC1	Q08959	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	CEX1	Q12453	761 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SSM4	P40318	1319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
SLX8	YER116C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SFL1	P20134	766 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	DYS1	P38791	387 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	PEX28	P38848	579 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YHR218W	P38899	603 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	CKB2	P38930	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	QRI7	P43122	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	NUT1	P53114	1132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YKU80	Q04437	629 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	HIM1	Q06674	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	GUD1	Q07729	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SCM3	Q12334	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	COB	P00163	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YER152C	P10356	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	AAC3	P18238	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	PCL2	P25693	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	RAD16	P31244	790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	FUN30	P31380	1131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	DOM34	P33309	386 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	PSY4	P38193	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	HXT13	P39924	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YGL140C	P53120	1219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	PCL10	P53124	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	HXT17	P53631	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	MRPL19	P53875	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	HXT15	P54854	567 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	PEX13	P80667	386 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	BLS1	Q06071	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	CDC45	Q08032	650 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	INO80	P53115	1489 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	DAL7	P21826	554 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	IRE1	P32361	1115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	DUR3	P33413	735 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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