RNA–Protein interactions for RNA: YOR208W

PTP2, Transcript of Nuclear phosphotyrosine-specific phosphatase involved in osmosensing, yeast

Gene PTP2, Length 2,253 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTP2	YOR208W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	2.28	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SPO20	Q04359	397 aa		2.28	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	YPL277C	Q08989	487 aa		2.28	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	RKM4	Q12504	494 aa		2.28	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	CLN2	P20438	545 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	AFR1	P33304	620 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	TOD6	P34219	525 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	YBR184W	P38299	523 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	CDC6	P09119	513 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	UBP5	P39944	805 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	PFD1	P46988	109 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SFB2	P53953	876 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	NPP1	P25353	742 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	AGP1	P25376	633 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	APL1	P27351	700 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	LAM1	P38851	1228 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SVF1	Q05515	481 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	DUS4	Q06063	367 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	GIC1	P38785	314 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	MEF2	P39677	819 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	IRC24	P40580	263 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SNO2	P53823	222 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	MSC2	Q03455	724 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	YDR132C	Q03900	495 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	MDM38	Q08179	573 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	GEM1	P39722	662 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	NIT1	P40447	199 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SGD1	Q06132	899 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	UBX5	Q06682	500 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.24	□□□□□ -2.05	not detected
PTP2	YOR208W	YBR284W	P38150	797 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SRT1	Q03175	343 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	YAP6	Q03935	383 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	RSM24	Q03976	319 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	ATG13	Q06628	738 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	YDR306C	Q06640	478 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	TOP3	P13099	656 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	LST4	P34239	828 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	FLR1	P38124	548 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	YAP1801	P38856	637 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SPT20	P50875	604 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	GCN5	Q03330	439 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SHE9	Q04172	456 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SOD2	P00447	233 aa		2.23	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SRP101	P32916	621 aa		2.23	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	RAD4	P14736	754 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	EMC1	P25574	760 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.22	□□□□□ -2.05	not detected
PTP2	YOR208W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	SIZ1	Q04195	904 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	ESC8	Q08119	714 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	ENA1	P13587	1091 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	ZRG8	P40021	1076 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	RRT14	P40470	206 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	IRR1	P40541	1150 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	ALR2	P43553	858 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	IOC3	P43596	787 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	ENA2	Q01896	1091 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	CDA1	Q06702	301 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	HMI1	Q12039	706 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	ENA5	Q12691	1091 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTP2	YOR208W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	CDC20	P26309	610 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	RPD3	P32561	433 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	MND2	P40577	368 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	RIM8	P53179	542 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	FMP25	Q08023	583 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	YPR071W	Q12346	211 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.21	□□□□□ -2.06	not detected
PTP2	YOR208W	PPH3	P32345	308 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	HUL5	P53119	910 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	YGR012W	P53206	393 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	TMA10	Q06177	86 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	EAF1	Q06337	982 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	TPO1	Q07824	586 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	GPB1	Q08886	897 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	OSW2	Q12202	724 aa		2.21	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	2.2	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	BET3	P36149	193 aa		2.2	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	PBY1	P38254	753 aa		2.2	□□□□□ -2.06
PTP2	YOR208W	GIP4	P39732	760 aa		2.2	□□□□□ -2.06

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