RNA–Protein interactions for RNA: YNR001C

CIT1, Transcript of Citrate synthase, yeast

Gene CIT1, Length 1,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIT1	YNR001C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	ERP2	P39704	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	MDG1	P53885	366 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	SSY1	Q03770	852 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	RAD27	P26793	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	CAB3	P36076	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	HLJ1	P48353	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	VPS15	P22219	1454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	NNK1	P36003	928 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	YKL077W	P36081	392 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	HUL4	P40985	892 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	DAS1	P47005	663 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	SPO20	Q04359	397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	CDA2	Q06703	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	TRE1	Q08919	783 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	NYV1	Q12255	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	PAN1	P32521	1480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	MSH3	P25336	1018 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	YKL222C	P35995	705 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	YBR184W	P38299	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	PAF1	P38351	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	GEM1	P39722	662 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	ORC3	P54790	616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	ULP1	Q02724	621 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	SLX4	Q12098	748 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	MMS22	Q06164	1454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	CAN1	P04817	590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	ADP1	P25371	1049 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	ARE1	P25628	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	PRO1	P32264	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	MNN4	P36044	1178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	YKL069W	P36088	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	EAF1	Q06337	982 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	NSI1	Q12457	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	NKP1	Q12493	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	CIT1	P00890	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	YAR028W	P39548	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	AIM21	P40563	679 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	PMT3	P47190	753 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	YGR237C	P50089	785 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	ERP6	P53198	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	PEX8	P53248	589 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	PEX13	P80667	386 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	ADI1	Q03677	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	MRL1	Q06815	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	GCR1	P07261	785 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	SAM35	P14693	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	MSH2	P25847	964 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	MRP8	P35719	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	RDH54	P38086	958 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	FUI1	P38196	639 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	PTC7	P38797	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	SHU2	P38957	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	IRR1	P40541	1150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	XKS1	P42826	600 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
CIT1	YNR001C	TPP1	Q03796	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	ESC8	Q08119	714 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	NTG2	Q08214	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	NUP145	P49687	1317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	DUT1	P33317	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIT1	YNR001C	SQT1	P35184	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 195.1 ms