RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	CYC8	P14922	966 aa		6.34	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	TIM23	P32897	222 aa		6.34	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	SIP3	P38717	1229 aa		6.34	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	FIS1	P40515	155 aa		6.34	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	PGA2	P53903	129 aa		6.34	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	SEC5	P89102	971 aa		6.34	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	CTR1	P49573	406 aa		6.33	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	ATG1	P53104	897 aa		6.33	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	ESC2	Q06340	456 aa		6.33	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	OSW7	P43611	510 aa		6.33	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	MET7	Q08645	548 aa		6.33	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.32	□□□□□ -1.4	not detected
AMD1	YML035C	TVP38	P36164	337 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	PIH1	P38768	344 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	VPS53	P47061	822 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	UBP15	P50101	1230 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	DIP5	P53388	608 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	YMR321C	Q04898	105 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	CRD1	Q07560	283 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	TRM11	Q12463	433 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	NCS6	P53088	359 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	GUP1	P53154	560 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	CUR1	Q06469	252 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	ICL2	Q12031	575 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	YUR1	P26725	428 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	AFT2	Q08957	416 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	RAM2	P29703	316 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	YEL025C	P39991	1188 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	TCO89	Q08921	799 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	PCK1	P10963	549 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	PPS1	P38148	807 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	PSY4	P38193	441 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	HUL4	P40985	892 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	YGR237C	P50089	785 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	MDR1	P53258	950 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	TLG2	Q08144	397 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	WAR1	Q03631	944 aa		6.29	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	POX1	P13711	748 aa		6.29	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	YFL034W	P43564	1073 aa		6.29	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	LSC2	P53312	427 aa		6.29	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	ROD1	Q02805	837 aa		6.29	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	YPL277C	Q08989	487 aa		6.29	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	MOT1	P32333	1867 aa		6.29	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	BIM1	P40013	344 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	YDL057W	Q07379	328 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	SMC5	Q08204	1093 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	YLL058W	Q12198	575 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	OM45	P16547	393 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	VID30	P53076	958 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	YML020W	Q03722	664 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	SVF1	Q05515	481 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	COG4	Q06096	861 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AMD1	YML035C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	PHO8	P11491	566 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	RPC53	P25441	422 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	MRC1	P25588	1096 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	YSC83	P32792	385 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	PRY3	P47033	881 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	ARK1	P53974	638 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	TMA16	Q08687	178 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	MED1	Q12321	566 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	RIF1	P29539	1916 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	PSO2	P30620	661 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	GPT2	P36148	743 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	UBP13	P38187	747 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	SCS3	P53012	380 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	COQ9	Q05779	260 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	YAP7	Q08182	245 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AMD1	YML035C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41

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