RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP4	YPR178W	SMC6	Q12749	1114 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	OM45	P16547	393 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	SQT1	P35184	431 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	HEL1	P36113	551 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	BTN2	P53286	410 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	RIT1	P23796	513 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	SGM1	P47166	707 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	URH1	Q04179	340 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PRP4	YPR178W	JIP3	O13555	125 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	GAL11	P19659	1081 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	RPC53	P25441	422 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	YKR075C	P36155	307 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	YHL050C	P38721	697 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	YJR039W	P47107	1121 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	YGR153W	P48238	217 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	TRS120	Q04183	1289 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	DPH6	Q12429	685 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	CIT1	P00890	479 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	SIP3	P38717	1229 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	RET3	P53600	189 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.18	□□□□□ -0.62	not detected
PRP4	YPR178W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	ILM1	P47155	203 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	ARG1	P22768	420 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	ICP55	P40051	511 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	YML119W	Q03208	357 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	UBX2	Q04228	584 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	ECI1	Q05871	280 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	RAD61	Q99359	647 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	RAD3	P06839	778 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	MIP1	P15801	1254 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	OAF3	P36023	863 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	YKR018C	P36114	725 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	KIC1	P38692	1080 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	DOT5	P40553	215 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	ADA2	Q02336	434 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	SIL1	Q08199	421 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	ZRT2	Q12436	422 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	TUP1	P16649	713 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	UBP1	P25037	809 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	TOF1	P53840	1238 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	YPR078C	Q06813	372 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	MLH2	Q07980	695 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	YPL216W	Q08964	1102 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	TAF10	Q12030	206 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	TUS1	Q06412	1307 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRP4	YPR178W	NUC1	P08466	329 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	CKA2	P19454	339 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	APL1	P27351	700 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	PET10	P36139	283 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	VID27	P40157	782 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	RPC17	P47076	161 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	KAP114	P53067	1004 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.14	□□□□□ -0.63	not detected
PRP4	YPR178W	SPL2	P38839	148 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	EEB1	Q02891	456 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	SPC24	Q04477	213 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	PRI1	P10363	409 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRP4	YPR178W	YCR051W	P25631	222 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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