RNA–Protein interactions for RNA: YPR059C

YPR059C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YPR059C, Length 387 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR059C	YPR059C	FBP1	P09201	348 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	SRM1	P21827	482 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	PRE8	P23639	250 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	DAL1	P32375	460 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	TOA1	P32773	286 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	LDH1	P38139	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	GPB2	P39717	880 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	SLX8	P40072	274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	IRC8	P47046	822 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	VPS62	P53285	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	GUT2	P32191	649 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	MAL31	P38156	614 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	RTS1	P38903	757 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	CEM1	P39525	442 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	YFL040W	P43562	540 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	YJL007C	P47080	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	SOL4	P53315	255 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	FMP30	Q02883	468 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	ISU1	Q03020	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	EAR1	Q03212	550 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	UBX5	Q06682	500 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	LAP2	Q10740	671 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	HIF1	Q12373	385 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	PDR18	P53756	1333 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	SRS2	P12954	1174 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	EUG1	P32474	517 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	MDJ1	P35191	511 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	YKR018C	P36114	725 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	PBY1	P38254	753 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	CUZ1	P53899	274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	MET7	Q08645	548 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
YPR059C	YPR059C	OPI1	P21957	404 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	POL32	P47110	350 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	YML037C	Q03703	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	KAR5	Q04746	504 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	TAH18	Q12181	623 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPR059C	YPR059C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	RGT1	P32862	1170 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	FIR1	P40020	876 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	UBP15	P50101	1230 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	DOS2	P54858	310 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	THI72	Q08579	599 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	RAD61	Q99359	647 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	CDC16	P09798	840 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	SLD2	P34252	453 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	YJR107W	P47145	328 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	SUT2	Q12286	268 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	RAD18	P10862	487 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	UIP5	P36137	443 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	MET1	P36150	593 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	VPS8	P39702	1274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	VID27	P40157	782 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	FRA1	Q07825	749 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	COQ1	P18900	473 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	DIT1	P21623	536 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	CHS3	P29465	1165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	TIM23	P32897	222 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	YFL066C	P43538	392 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YPR059C	YPR059C	MRPS35	P53292	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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