RNA–Protein interactions for RNA: YMR172W

HOT1, Transcript of Transcription factor for glycerol biosynthetic genes, yeast

Gene HOT1, Length 2,160 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOT1	YMR172W	DPB3	P27344	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	MGM1	P32266	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	VPH2	P32341	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	BUD2	P33314	1104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	ESL2	P36168	1195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	CDC27	P38042	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	IFA38	P38286	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SAP185	P40856	1058 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	URB2	P47108	1174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	ATG17	Q06410	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	TAF3	Q12297	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SEC2	P17065	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	ARG1	P22768	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	APN1	P22936	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	ATO2	P32907	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SLA2	P33338	968 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	UIP5	P36137	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	MEF2	P39677	819 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	ERP2	P39704	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	TMN3	P40071	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	TRS85	P46944	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	MDV1	P47025	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	YRM1	Q12340	786 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	LYS2	P07702	1392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	VPS15	P22219	1454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	KAR1	P11927	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	NMT1	P14743	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	YKL063C	P35725	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	FES1	P38260	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	TFB2	Q02939	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SGD1	Q06132	899 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	MSH5	Q12175	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SCM3	Q12334	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	ERP4	Q12450	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	IME1	P21190	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SMI1	P32566	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	DUR3	P33413	735 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	MIA40	P36046	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	RGA1	P39083	1007 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	BOI2	P39969	1040 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	FCY21	P40039	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	MRX1	P40050	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	IRR1	P40541	1150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	YJR079W	P47126	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SSN8	P47821	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	UBA2	P52488	636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	MAL13	P53338	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	RCM1	P53972	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SVF1	Q05515	481 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	MCM16	Q12262	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	MSH2	P25847	964 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	NPL4	P33755	580 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	RSM22	P36056	628 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SLX1	P38324	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	PPX1	P38698	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	STB2	P46679	850 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	APS3	P47064	194 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	PEX21	P50091	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	GCR2	Q01722	534 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	FIN1	Q03898	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	DYN3	Q04949	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	ARV1	Q06541	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	ATG23	Q06671	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOT1	YMR172W	OPY2	Q06810	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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