RNA–Protein interactions for RNA: YMR135W-A

YMR135W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR135W-A, Length 534 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR135W-AYMR135W-A MSH6Q03834 1242 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A HBN1Q96VH4 193 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A GSY1P23337 708 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A VBA3P25594 458 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A KTR4P38131 464 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A SUM1P46676 1062 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A BNA1P47096 177 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A HEH2Q03281 663 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A HDA2Q06629 674 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A UTP4Q06679 776 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A HOM3P10869 527 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A CHS3P29465 1165 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A SQT1P35184 431 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A PEX28P38848 579 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A CCC2P38995 1004 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A GPP2P40106 250 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A VTC2P43585 828 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A NIT2P47016 307 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A MET13P53128 600 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A RSC1P53236 928 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A SIW14P53965 281 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A OPY2Q06810 360 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A YDR056CQ12025 205 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A WTM2Q12206 467 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A TOM70P07213 617 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A TOP3P13099 656 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A AEP2P22136 580 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A FBP26P32604 452 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A HBS1P32769 611 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A DUR3P33413 735 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A APE4P38821 490 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A ACA1P39970 489 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A TMA108P40462 946 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A RSM26P47141 266 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A ENT3P47160 408 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A YGL140CP53120 1219 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A YLR352WQ06479 807 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A INO1P11986 533 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A URA1P28272 314 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A MRF1P30775 413 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data6.28□□□□□ -1.4not detected
YMR135W-AYMR135W-A MOT2P34909 587 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A ECM2P38241 364 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A QDR2P40474 542 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A HIS6P40545 261 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A RRN7P40992 514 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A SAP155P43612 1002 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A YJR096WP47137 282 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A IMH1Q06704 911 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YMR135W-AYMR135W-A HSP82P02829 709 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A PRT1P06103 763 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A RAD53P22216 821 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A YEL1P34225 687 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A VRP1P37370 817 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A YBR287WP38355 427 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A XDJ1P39102 459 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A MBP1P39678 833 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A CNN1P43618 361 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A IML2P47031 731 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A TAN1P53072 289 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A APP1P53933 587 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A PMT7Q06644 662 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A SRD1P09007 221 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A HEM13P11353 328 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A BCK2P33306 851 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A PEX5P35056 612 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A NUP120P35729 1037 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A PES4P39684 611 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A UBP6P43593 499 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A VPS30Q02948 557 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A PHM6Q05637 104 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A RKM4Q12504 494 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A Q0182Q9ZZW1 134 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A CDC9P04819 755 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A MOD5P07884 428 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A STE6P12866 1290 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A PCL2P25693 308 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A PRP19P32523 503 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A ANP1P32629 500 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A DOM34P33309 386 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A MKS1P34072 584 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A YKL050CP35736 922 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A DOT6P40059 670 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A NPY1P53164 384 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A HOL1P53389 586 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A NOG1Q02892 647 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A TRS130Q03660 1102 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A RCF1Q03713 159 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A IRC3Q06683 689 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A SDH5Q08230 162 aa6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A PUS1Q12211 544 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YMR135W-AYMR135W-A CYB2P00175 591 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.9 ms