RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	THI6	P41835	540 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	JIP4	Q03361	876 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	ROG3	P43602	733 aa		6.4	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	TY3A-G	Q12173	290 aa		6.4	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	TY3A-I	Q99219	290 aa		6.4	□□□□□ -1.38
AMD1	YML035C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	GPA1	P08539	472 aa		6.4	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	CKA2	P19454	339 aa		6.4	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	EUG1	P32474	517 aa		6.4	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	UTR4	P32626	227 aa		6.4	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ASH1	P34233	588 aa		6.4	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	NPR3	P38742	1146 aa		6.4	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	SPR3	P41901	512 aa		6.4	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	YGR125W	P53273	1036 aa		6.4	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	6.4	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	FOB1	O13329	566 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	IXR1	P33417	597 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	YER130C	P39959	443 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ORC4	P54791	529 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	TAF13	P11747	167 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	GSY1	P23337	708 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	YGR273C	P53329	174 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	AIM33	Q04516	312 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	OXR1	Q08952	273 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ARP6	Q12509	438 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	HIR1	P32479	840 aa		6.38	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ISW1	P38144	1129 aa		6.38	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	UBA2	P52488	636 aa		6.38	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	FUS2	Q05670	677 aa		6.38	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	MNR2	P35724	969 aa		6.38	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	SGD1	Q06132	899 aa		6.38	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	SEC8	P32855	1065 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	VPS29	P38759	282 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ERP3	Q12403	225 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	SRF1	Q12516	437 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	SMC6	Q12749	1114 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ECM29	P38737	1868 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	CLB5	P30283	435 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	UBP11	P36026	717 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	MRPL10	P36520	322 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	RRM3	P38766	723 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ORC6	P38826	435 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	VTC2	P43585	828 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	CBK1	P53894	756 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	PHM6	Q05637	104 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	GSY2	P27472	705 aa		6.36	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	SHP1	P34223	423 aa		6.36	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	FYV10	P40492	516 aa		6.36	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	RKM4	Q12504	494 aa		6.36	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	NUP82	P40368	713 aa		6.36	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	BRE2	P43132	505 aa		6.36	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ADY4	Q05955	493 aa		6.36	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	YLR464W	P0CX17	216 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	MIP1	P15801	1254 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ATE1	P16639	503 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	SUV3	P32580	737 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	PET10	P36139	283 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	YEL076C	P39971	216 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	MXR1	P40029	184 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	DUS4	Q06063	367 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ESS1	P22696	170 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	CDC15	P27636	974 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	HUL5	P53119	910 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	SLD5	Q03406	294 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	YLH47	Q06493	454 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	PSR2	Q07949	397 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	SRD1	P09007	221 aa		6.34	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	CLN3	P13365	580 aa		6.34	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	RGT1	P32862	1170 aa		6.34	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	TFC4	P33339	1025 aa		6.34	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	REG2	P38232	338 aa		6.34	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	BCD1	P38772	366 aa		6.34	□□□□□ -1.39
AMD1	YML035C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.2 ms