RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa29.28■■■□□ 2.28
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dcaf5Q80T85 946 aa29.28■■■□□ 2.28
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eif4a2P10630 407 aa29.27■■■□□ 2.28
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Phkg2Q9DB30 406 aa29.27■■■□□ 2.28
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa29.27■■■□□ 2.28
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa29.26■■■□□ 2.28
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cfap70D3YVL2 1141 aa29.26■■■□□ 2.27
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sos1Q62245 1319 aa29.25■■■□□ 2.27
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zscan10Q3URR7 782 aa29.25■■■□□ 2.27
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cap2Q9CYT6 476 aa29.25■■■□□ 2.27
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa29.23■■■□□ 2.27
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Klrk1O54709 232 aa29.22■■■□□ 2.27
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PgfP49764 158 aa29.21■■■□□ 2.27
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Golgb1E9PVZ8 3238 aa29.2■■■□□ 2.27
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gja3Q64448 417 aa29.2■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pdzd9Q9D9M4 266 aa29.2■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 EgfrQ01279 1210 aa29.19■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Klhdc4Q921I2 584 aa29.19■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SobpQ0P5V2 864 aa29.18■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ssfa2Q922B9 1252 aa29.18■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Amhr2Q8K592 568 aa29.17■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dcaf11Q91VU6 549 aa29.17■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ric1Q69ZJ7 1422 aa29.15■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slurp2P0DP59 97 aa29.15■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MpripP97434 1024 aa29.15■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 IarsQ8BU30 1262 aa29.15■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 WasP70315 520 aa29.14■■■□□ 2.26
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Spef2Q8C9J3 1734 aa29.12■■■□□ 2.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slfnl1Q8BHW9 410 aa29.11■■■□□ 2.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Chmp7Q8R1T1 451 aa29.11■■■□□ 2.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa29.11■■■□□ 2.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kndc1Q0KK55 1742 aa29.11■■■□□ 2.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rbm46P86049 533 aa29.1■■■□□ 2.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfyve9A2A8R0 1397 aa29.08■■■□□ 2.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Plin1Q8CGN5 517 aa29.07■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrrc43Q3V0L5 667 aa29.06■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col24a1Q30D77 1733 aa29.05■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 XpcP51612 930 aa29.03■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gjd4Q8BSD4 364 aa29.03■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rsph6aQ8CDR2 708 aa29.03■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wdhd1P59328 1117 aa29.02■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp1r1bQ60829 194 aa29.02■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tktl2Q9D4D4 627 aa29.01■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col4a5Q63ZW6 1691 aa29.01■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Aox2Q5SGK3 1345 aa29■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa29■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nkx2-3P97334 362 aa28.99■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa28.98■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atp1b3P97370 278 aa28.98■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trim28Q62318 834 aa28.98■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q8C6G1 249 aa28.98■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa28.97■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Clcn1Q64347 994 aa28.97■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc155Q80VJ8 648 aa28.97■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ciapin1Q8WTY4 309 aa28.97■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tango6Q8C3S2 1079 aa28.96■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nkx1-1G3UXB3 402 aa28.94■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PrimpolQ6P1E7 537 aa28.94■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Amotl1Q9D4H4 968 aa28.93■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp1r15aP17564 657 aa28.92■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DaglaQ6WQJ1 1044 aa28.92■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HypkQ9CR41 129 aa28.92■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nav1Q8CH77 1875 aa28.91■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AceP09470 1312 aa28.91■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atf5O70191 283 aa28.9■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Spire2Q8K1S6 718 aa28.9■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fbxo33Q8VE08 562 aa28.9■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Syde2E9PUP1 1314 aa28.9■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa28.89■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CfhP06909 1234 aa28.89■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa28.88■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3043K7N693 218 aa28.88■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm16440K7N6G6 218 aa28.88■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm2244L7N2A3 218 aa28.88■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3278L7N2D2 218 aa28.88■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm8271L7N2E2 218 aa28.88■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trip6Q9Z1Y4 480 aa28.88■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gja5Q01231 358 aa28.87■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Setdb1O88974 1307 aa28.87■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ubn2Q80WC1 1314 aa28.87■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa28.86■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pde4dQ01063 747 aa28.86■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dusp27Q148W8 1138 aa28.86■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Usp19Q3UJD6 1360 aa28.86■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cd248Q91V98 765 aa28.85■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NpcdF8VQB8 469 aa28.84■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mcm10Q0VBD2 885 aa28.84■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zbtb1Q91VL9 713 aa28.84■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Efcab2Q9CQ46 164 aa28.84■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.9 ms