RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa51,53■■■■■ 5,84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NischQ80TM9 1593 aa50,27■■■■■ 5,64
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abcc9P70170 1546 aa49,43■■■■■ 5,5
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abcc8B2RUS7 1588 aa48,98■■■■■ 5,43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ScribQ80U72 1612 aa48,14■■■■■ 5,3
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NacadQ5SWP3 1504 aa46,26■■■■■ 5
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kdm5dQ62240 1548 aa46,17■■■■■ 4,98
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa45,91■■■■■ 4,94
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sycp2Q9CUU3 1500 aa45,47■■■■■ 4,87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 BicraF8VPZ9 1578 aa45,16■■■■■ 4,82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dcaf1Q80TR8 1506 aa44,78■■■■■ 4,76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP44,24■■■■■ 4,67
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP43,97■■■■■ 4,63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa43,74■■■■■ 4,59
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa43,48■■■■■ 4,55
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP43,32■■■■■ 4,53
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ercc6F8VPZ5 1481 aa43,04■■■■■ 4,48
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Baz1aO88379 1555 aa42,96■■■■■ 4,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam135aQ6NS59 1506 aa42,92■■■■■ 4,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Crybg2B7ZCC2 1516 aa42,87■■■■■ 4,45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smarca2Q6DIC0 1577 aa42,74■■■■■ 4,43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc180J3QNE4 1664 aa42,68■■■■■ 4,42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dnajc5P60904 198 aa42,68■■■■■ 4,42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP42,62■■■■■ 4,41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP42,5■■■■■ 4,39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa42,5■■■■■ 4,39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wdr62Q3U3T8 1523 aa42,33■■■■■ 4,37
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Frmpd1A2AKB4 1549 aa42,29■■■■■ 4,36
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP42,25■■■■■ 4,35
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Baz1bQ9Z277 1479 aa42,16■■■■■ 4,34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rhox8Q6VSS7 320 aa42,13■■■■■ 4,33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa42,11■■■■■ 4,33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trim41Q5NCC3 630 aa42,08■■■■■ 4,33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ubl4bQ9CQ84 188 aa41,95■■■■■ 4,31
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mrc2Q64449 1479 aa41,89■■■■■ 4,3
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Unc13aQ4KUS2 1712 aa41,79■■■■■ 4,28
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa41,17■■■■■ 4,18
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40,89■■■■■ 4,14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CftrP26361 1476 aa40,81■■■■■ 4,12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa40,8■■■■■ 4,12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Shroom2A2ALU4 1481 aa40,7■■■■■ 4,11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kif21aQ9QXL2 1672 aa40,67■■■■■ 4,1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Synj1Q8CHC4 1574 aa40,66■■■■■ 4,1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cux2P70298 1426 aa40,59■■■■■ 4,09
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP40,52■■■■■ 4,08
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col17a1Q07563 1470 aa40,47■■■■■ 4,07
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kif15Q6P9L6 1387 aa40,31■■■■■ 4,04
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP40,24■■■■■ 4,03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Top2bQ64511 1612 aa40,03■■■■■ 4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP40,02■■■■■ 4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP39,97■■■■□ 3,99
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP39,94■■■■□ 3,98
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP39,93■■■■□ 3,98
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lamc3Q9R0B6 1581 aa39,91■■■■□ 3,98
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rtl1Q7M732 1744 aa39,81■■■■□ 3,96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Plb1Q3TTY0 1478 aa39,79■■■■□ 3,96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cep164Q5DU05 1446 aa39,76■■■■□ 3,96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa39,73■■■■□ 3,95
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP39,71■■■■□ 3,95
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP39,63■■■■□ 3,93
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP39,63■■■■□ 3,93
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa39,49■■■■□ 3,91
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rusc2Q80U22 1514 aa39,49■■■■□ 3,91
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Crocc2F6XLV1 1638 aa39,45■■■■□ 3,91
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Il27Q8K3I6 234 aa39,36■■■■□ 3,89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP39,3■■■■□ 3,88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ift140E9PY46 1464 aa39,26■■■■□ 3,88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc18Q640L5 1455 aa39,25■■■■□ 3,87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa39,23■■■■□ 3,87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TnnQ80Z71 1560 aa39,1■■■■□ 3,85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Camsap1A2AHC3 1581 aa39,09■■■■□ 3,85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Adgrl3Q80TS3 1537 aa39,06■■■■□ 3,84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP38,98■■■■□ 3,83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa38,95■■■■□ 3,83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Disp1Q3TDN0 1521 aa38,87■■■■□ 3,81
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Setd1bQ8CFT2 1985 aa38,86■■■■□ 3,81
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PtprkP35822 1457 aa38,82■■■■□ 3,81
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cep170Q6A065 1588 aa38,82■■■■□ 3,8
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Duox2A2AQ99 1517 aa38,79■■■■□ 3,8
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PtprtQ99M80 1454 aa38,77■■■■□ 3,8
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm156Q58A37 223 aa38,73■■■■□ 3,79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Golga3P55937 1487 aa38,7■■■■□ 3,79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP38,7■■■■□ 3,79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa38,69■■■■□ 3,78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa38,65■■■■□ 3,78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP38,61■■■■□ 3,77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Samd9lQ69Z37 1561 aa38,56■■■■□ 3,76
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fgd6Q69ZL1 1399 aa38,47■■■■□ 3,75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pprc1Q6NZN1 1644 aa38,46■■■■□ 3,75
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Grin2bQ01097 1482 aa38,4■■■■□ 3,74
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP38,37■■■■□ 3,73
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cngb1E1AZ71 1325 aa38,32■■■■□ 3,72
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rad54l2Q99NG0 1466 aa38,31■■■■□ 3,72
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abcc1O35379 1528 aa38,27■■■■□ 3,72
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Grin2aP35436 1464 aa38,26■■■■□ 3,72
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AknaQ80VW7 1404 aa38,24■■■■□ 3,71
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fmn1Q05860 1466 aa38,23■■■■□ 3,71
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa38,23■■■■□ 3,71
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Magi3Q9EQJ9 1476 aa38,22■■■■□ 3,71
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP38,22■■■■□ 3,71
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