RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA VPS53P47061 822 aa4.58□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA ENT3P47160 408 aa4.58□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA RSC58Q07979 502 aa4.58□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA PET112P33893 541 aa4.57□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA MNR2P35724 969 aa4.57□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA PAM1P37304 830 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA FOL2P51601 243 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA NOP7P53261 605 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA TAD3Q9URQ3 322 aa4.57□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA ALG3P38179 458 aa4.57□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA SNO2P53823 222 aa4.57□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data4.57□□□□□ -1.68not detected
15S_rRNA15S_rRNA PTC5Q12511 572 aa4.57□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA YPT53P36019 220 aa4.56□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA ROD1Q02805 837 aa4.56□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA CLN2P20438 545 aa4.55□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA SHM2P37291 469 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA SIW14P53965 281 aa4.55□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA MRL1Q06815 381 aa4.55□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA YLR358CO13565 187 aa4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA SNF5P18480 905 aa4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA BAP2P38084 609 aa4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA YFL054CP43549 646 aa4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA GNP1P48813 663 aa4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA GSF2Q04697 403 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA RTT10Q08924 1013 aa4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA SPO21Q12411 609 aa4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA GCR1P07261 785 aa4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA SPS1P08458 490 aa4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA HXT13P39924 564 aa4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA HXT17P53631 564 aa4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA HXT15P54854 567 aa4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA TMA46Q12000 345 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA COQ4O13525 335 aa4.53□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA CDC34P14682 295 aa4.53□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA RAD27P26793 382 aa4.53□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA TNA1P53322 534 aa4.53□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA HOS3Q02959 697 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA YDR132CQ03900 495 aa4.53□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
15S_rRNA15S_rRNA MKK2P32491 506 aa4.52□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA MET10P39692 1035 aa4.52□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA MAD1P40957 749 aa4.52□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA PIN2Q12057 282 aa4.52□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA TUB2P02557 457 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data4.51□□□□□ -1.69not detected
15S_rRNA15S_rRNA VPS16Q03308 798 aa4.51□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA NBA1Q08229 501 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA DUT1P33317 147 aa4.5□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA CCZ1P38273 704 aa4.5□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA CTS1P29029 562 aa4.5□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA PIK1P39104 1066 aa4.5□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA RPN3P40016 523 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA SEC26P41810 973 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA YPL260WQ08977 551 aa4.5□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA CYC1P00044 109 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA LAM1P38851 1228 aa4.49□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA PLB2Q03674 706 aa4.49□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA SGD1Q06132 899 aa4.49□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA PNS1Q12412 539 aa4.49□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA YER152CP10356 443 aa4.48□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA SYP1P25623 870 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data4.48□□□□□ -1.69not detected
15S_rRNA15S_rRNA MEF2P39677 819 aa4.48□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA SPT20P50875 604 aa4.48□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA YGR053CP53234 283 aa4.48□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA ROT1Q03691 256 aa4.48□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA RSB1Q08417 382 aa4.48□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA YOR352WQ08816 343 aa4.48□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA DBP5P20449 482 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA SRM1P21827 482 aa4.47□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA MLS1P30952 554 aa4.47□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA RER2P35196 286 aa4.47□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA TAT2P38967 592 aa4.47□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA CNN1P43618 361 aa4.47□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA CWC24P53769 259 aa4.47□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA GCN5Q03330 439 aa4.47□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA RIB2Q12362 591 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA LYP1P32487 611 aa4.46□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA RGD1P38339 666 aa4.46□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA KRI1P42846 591 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA FAA4P47912 694 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA ENV11P53246 860 aa4.46□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA EEB1Q02891 456 aa4.46□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA GDE1Q02979 1223 aa4.46□□□□□ -1.69
15S_rRNA15S_rRNA TRP2P00899 507 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
15S_rRNA15S_rRNA PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data4.46□□□□□ -1.7not detected
15S_rRNA15S_rRNA HNT2P49775 206 aa4.46□□□□□ -1.7
15S_rRNA15S_rRNA TYW3P53177 273 aa4.46□□□□□ -1.7
15S_rRNA15S_rRNA DUS4Q06063 367 aa4.46□□□□□ -1.7
15S_rRNA15S_rRNA GAL10P04397 699 aa4.45□□□□□ -1.7
15S_rRNA15S_rRNA MPH1P40562 993 aa4.45□□□□□ -1.7
15S_rRNA15S_rRNA ALD6P54115 500 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
15S_rRNA15S_rRNA NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data4.45□□□□□ -1.7not detected
15S_rRNA15S_rRNA TIF35Q04067 274 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
15S_rRNA15S_rRNA SPO20Q04359 397 aa4.45□□□□□ -1.7
15S_rRNA15S_rRNA CMP2P14747 604 aa4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45 ms