Protein–RNA interactions for Protein: Q99519

NEU1, Sialidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU1Q99519 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEU1Q99519 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEU1Q99519 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEU1Q99519 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEU1Q99519 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEU1Q99519 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEU1Q99519 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEU1Q99519 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEU1Q99519 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEU1Q99519 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEU1Q99519 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEU1Q99519 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEU1Q99519 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEU1Q99519 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEU1Q99519 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEU1Q99519 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEU1Q99519 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEU1Q99519 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEU1Q99519 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEU1Q99519 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEU1Q99519 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEU1Q99519 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEU1Q99519 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEU1Q99519 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEU1Q99519 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEU1Q99519 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEU1Q99519 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEU1Q99519 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEU1Q99519 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU1Q99519 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEU1Q99519 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEU1Q99519 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEU1Q99519 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU1Q99519 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEU1Q99519 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEU1Q99519 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEU1Q99519 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEU1Q99519 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEU1Q99519 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEU1Q99519 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEU1Q99519 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEU1Q99519 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEU1Q99519 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEU1Q99519 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEU1Q99519 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEU1Q99519 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEU1Q99519 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU1Q99519 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEU1Q99519 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEU1Q99519 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEU1Q99519 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEU1Q99519 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEU1Q99519 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEU1Q99519 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEU1Q99519 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEU1Q99519 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU1Q99519 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU1Q99519 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU1Q99519 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU1Q99519 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU1Q99519 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEU1Q99519 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU1Q99519 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU1Q99519 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU1Q99519 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEU1Q99519 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEU1Q99519 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEU1Q99519 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEU1Q99519 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEU1Q99519 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEU1Q99519 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU1Q99519 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU1Q99519 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU1Q99519 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEU1Q99519 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEU1Q99519 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEU1Q99519 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEU1Q99519 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEU1Q99519 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEU1Q99519 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU1Q99519 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU1Q99519 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU1Q99519 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU1Q99519 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEU1Q99519 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU1Q99519 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEU1Q99519 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEU1Q99519 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEU1Q99519 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU1Q99519 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU1Q99519 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEU1Q99519 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU1Q99519 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEU1Q99519 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEU1Q99519 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU1Q99519 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU1Q99519 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU1Q99519 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEU1Q99519 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEU1Q99519 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms