Protein–RNA interactions for Protein: Q12111

YDR029W, Uncharacterized protein YDR029W, yeastyeast

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR029WQ12111 NSR1YGR159C 1245 nt13.93□□□□□ -0.18
YDR029WQ12111 YML009W-BYML009W-B 477 nt13.88□□□□□ -0.19
YDR029WQ12111 NOP1YDL014W 984 nt13.57□□□□□ -0.24
YDR029WQ12111 YKL036CYKL036C 393 nt12.39□□□□□ -0.43
YDR029WQ12111 MDJ1YFL016C 1536 nt12.32□□□□□ -0.44
YDR029WQ12111 Q0297Q0297 156 nt11.81□□□□□ -0.52
YDR029WQ12111 SRX1YKL086W 384 nt11.81□□□□□ -0.52
YDR029WQ12111 SSA3YBL075C 1950 nt11.66□□□□□ -0.54
YDR029WQ12111 YJL027CYJL027C 417 nt11.53□□□□□ -0.56
YDR029WQ12111 SCS3YGL126W 1143 nt11.18□□□□□ -0.62
YDR029WQ12111 YCR051WYCR051W 669 nt11.14□□□□□ -0.63
YDR029WQ12111 DBP2YNL112W 1641 nt10.87□□□□□ -0.67
YDR029WQ12111 TRN1tP(UGG)A 72 nt10.71□□□□□ -0.69
YDR029WQ12111 SUF9tP(UGG)F 72 nt10.71□□□□□ -0.69
YDR029WQ12111 SUF8tP(UGG)H 72 nt10.71□□□□□ -0.69
YDR029WQ12111 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt10.71□□□□□ -0.69
YDR029WQ12111 SUF7tP(UGG)M 72 nt10.71□□□□□ -0.69
YDR029WQ12111 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt10.71□□□□□ -0.69
YDR029WQ12111 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt10.71□□□□□ -0.69
YDR029WQ12111 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt10.71□□□□□ -0.69
YDR029WQ12111 SUF11tP(UGG)O2 72 nt10.71□□□□□ -0.69
YDR029WQ12111 YOL085CYOL085C 342 nt10.68□□□□□ -0.7
YDR029WQ12111 YBR190WYBR190W 312 nt10.64□□□□□ -0.71
YDR029WQ12111 RPP1BYDL130W 321 nt10.58□□□□□ -0.72
YDR029WQ12111 CCC1YLR220W 969 nt10.51□□□□□ -0.73
YDR029WQ12111 PKP1YIL042C 1185 nt10.45□□□□□ -0.74
YDR029WQ12111 RVS167YDR388W 1449 nt10.36□□□□□ -0.75
YDR029WQ12111 RTC3YHR087W 336 nt10.34□□□□□ -0.75
YDR029WQ12111 SCJ1YMR214W 1134 nt10.14□□□□□ -0.79
YDR029WQ12111 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.08□□□□□ -0.8
YDR029WQ12111 PET122YER153C 765 nt10.05□□□□□ -0.8
YDR029WQ12111 SCR1SCR1 522 nt10.04□□□□□ -0.8
YDR029WQ12111 ATS1YAL020C 1002 nt9.98□□□□□ -0.81
YDR029WQ12111 PAC11YDR488C 1602 nt9.96□□□□□ -0.81
YDR029WQ12111 NVJ2YPR091C 2313 nt9.96□□□□□ -0.82
YDR029WQ12111 SHR5YOL110W 714 nt9.93□□□□□ -0.82
YDR029WQ12111 SSA4YER103W 1929 nt9.84□□□□□ -0.83
YDR029WQ12111 FPS1YLL043W 2010 nt9.83□□□□□ -0.84
YDR029WQ12111 YDJ1YNL064C 1230 nt9.81□□□□□ -0.84
YDR029WQ12111 RRN5YLR141W 1092 nt9.75□□□□□ -0.85
YDR029WQ12111 PUT4YOR348C 1884 nt9.74□□□□□ -0.85
YDR029WQ12111 SPT5YML010W 3192 nt9.73□□□□□ -0.85
YDR029WQ12111 URN1YPR152C 1398 nt9.65□□□□□ -0.86
YDR029WQ12111 SSA1YAL005C 1929 nt9.62□□□□□ -0.87
YDR029WQ12111 BDF1YLR399C 2061 nt9.61□□□□□ -0.87
YDR029WQ12111 RPN10YHR200W 807 nt9.61□□□□□ -0.87
YDR029WQ12111 YER088W-BYER088W-B 147 nt9.57□□□□□ -0.88
YDR029WQ12111 OPI9YLR338W 858 nt9.56□□□□□ -0.88
YDR029WQ12111 RSB1YOR049C 1065 nt9.56□□□□□ -0.88
YDR029WQ12111 DEP1YAL013W 1218 nt9.55□□□□□ -0.88
YDR029WQ12111 YNL208WYNL208W 600 nt9.52□□□□□ -0.89
YDR029WQ12111 GAR1YHR089C 618 nt9.51□□□□□ -0.89
YDR029WQ12111 TAT1YBR069C 1860 nt9.47□□□□□ -0.89
YDR029WQ12111 SAH1YER043C 1350 nt9.45□□□□□ -0.9
YDR029WQ12111 ARE1YCR048W 1833 nt9.44□□□□□ -0.9
YDR029WQ12111 YJL225CYJL225C 5277 nt9.39□□□□□ -0.91
YDR029WQ12111 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt9.34□□□□□ -0.91
YDR029WQ12111 PUN1YLR414C 792 nt9.33□□□□□ -0.92
YDR029WQ12111 BSC6YOL137W 1494 nt9.32□□□□□ -0.92
YDR029WQ12111 POA1YBR022W 534 nt9.31□□□□□ -0.92
YDR029WQ12111 PST2YDR032C 597 nt9.25□□□□□ -0.93
YDR029WQ12111 TIR1YER011W 765 nt9.23□□□□□ -0.93
YDR029WQ12111 YJR018WYJR018W 363 nt9.22□□□□□ -0.93
YDR029WQ12111 UME6YDR207C 2511 nt9.16□□□□□ -0.94
YDR029WQ12111 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.14□□□□□ -0.95
YDR029WQ12111 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.14□□□□□ -0.95
YDR029WQ12111 PTC2YER089C 1395 nt9.14□□□□□ -0.95
YDR029WQ12111 BUD23YCR047C 828 nt9.1□□□□□ -0.95
YDR029WQ12111 NAB2YGL122C 1578 nt9.09□□□□□ -0.95
YDR029WQ12111 RPP2BYDR382W 333 nt9.08□□□□□ -0.96
YDR029WQ12111 YJR120WYJR120W 351 nt8.98□□□□□ -0.97
YDR029WQ12111 INM2YDR287W 879 nt8.96□□□□□ -0.98
YDR029WQ12111 DAL1YIR027C 1383 nt8.96□□□□□ -0.98
YDR029WQ12111 FIS1YIL065C 468 nt8.92□□□□□ -0.98
YDR029WQ12111 YKL097CYKL097C 411 nt8.88□□□□□ -0.99
YDR029WQ12111 MEP2YNL142W 1500 nt8.88□□□□□ -0.99
YDR029WQ12111 SHU1YHL006C 453 nt8.86□□□□□ -0.99
YDR029WQ12111 FPR4YLR449W 1179 nt8.86□□□□□ -0.99
YDR029WQ12111 BDH2YAL061W 1254 nt8.85□□□□□ -0.99
YDR029WQ12111 PHO4YFR034C 939 nt8.84□□□□□ -0.99
YDR029WQ12111 YGR021WYGR021W 873 nt8.83□□□□□ -1
YDR029WQ12111 SRB2YHR041C 633 nt8.82□□□□□ -1
YDR029WQ12111 YBL100CYBL100C 315 nt8.82□□□□□ -1
YDR029WQ12111 WWM1YFL010C 636 nt8.76□□□□□ -1.01
YDR029WQ12111 YBR220CYBR220C 1683 nt8.75□□□□□ -1.01
YDR029WQ12111 LSM3YLR438C-A 270 nt8.75□□□□□ -1.01
YDR029WQ12111 GUT2YIL155C 1950 nt8.73□□□□□ -1.01
YDR029WQ12111 PCH2YBR186W 1695 nt8.73□□□□□ -1.01
YDR029WQ12111 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt8.73□□□□□ -1.01
YDR029WQ12111 HOM6YJR139C 1080 nt8.71□□□□□ -1.02
YDR029WQ12111 YPS1YLR120C 1710 nt8.7□□□□□ -1.02
YDR029WQ12111 FUN26YAL022C 1554 nt8.69□□□□□ -1.02
YDR029WQ12111 TRM9YML014W 840 nt8.69□□□□□ -1.02
YDR029WQ12111 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt8.67□□□□□ -1.02
YDR029WQ12111 BOR1YNL275W 1731 nt8.66□□□□□ -1.02
YDR029WQ12111 DCW1YKL046C 1350 nt8.65□□□□□ -1.02
YDR029WQ12111 YDR095CYDR095C 411 nt8.65□□□□□ -1.02
YDR029WQ12111 SEC11YIR022W 504 nt8.65□□□□□ -1.02
YDR029WQ12111 MCH5YOR306C 1566 nt8.64□□□□□ -1.03
YDR029WQ12111 ALF1YNL148C 765 nt8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms