Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MED13Q9UHV7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms