Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms