Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms