Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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