Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms