Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRC4Q9NPP4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms