Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms