Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC22CQ9BRL7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms