Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms