Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms