Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms