Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms