Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms