Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MKL1Q969V6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKL1Q969V6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms