Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUFY2Q8WXA3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms