Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJA4Q8WW22 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms