Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H1FOOQ8IZA3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms